2.4.2 PCR-ARISA
2026年07月26日
2.4.2 PCR-ARISA
用特定引物(表2-5)分别对样品中的细菌和古菌进行PCR扩增。产甲烷菌的PCR扩增条件为:1×PCR缓冲液,0.75 U的Taq DNA聚合酶(Thermo Start Taq DNA Polymerase kit),0.2 mmol/L核苷酸(A、G、C、T),0.40μmol/L引物,1.5 mmol/L MgCl2,最终体积25μL。古菌的PCR程序为:94℃5 min,35个循环(94℃1 min,54.8℃1 min,72℃2 min),72℃延伸10 min。细菌的PCR程序为:94℃5 min,35个循环(94℃1 min,54.5℃1 min,72℃2 min),72℃延伸10 min。反应在EP Silver循环变温加热器(Eppendorf AG,Hamburg,Germany)内进行。
表2-5 ARISA-PCR扩增中的引物序列(https://www.daowen.com)

采用Agilent DNA 1000试剂盒(Agilent Technologies Inc.,California,U.S.A)在Agilent 2100 Bioanalyzer(Agilent Technologies Inc.,California,U.S.A.)中进行PCR产物的ARISA分析。