水轮机主轴密封采用静压自调节式密封，置在导轴承下方。该密封设有压水腔，可依据顶盖水压自动调整压力，在整个运行期间，可对磨损进行自动补偿。正常运行时，该密封装置少量漏水可通过排水管自流排走。密封进口冷却水压为0.3～0.7MPa，水质100μm。
密封副抗磨板采用高性能不锈钢钢板0Cr13Ni5Mo，密封副的密封环采用耐磨高分子聚合物。
主轴检修密封位于工作密封下，采用压缩空气充气的围带橡胶密封结构。机组检修或长时间停机时，围带内需冲入压力约为0.7MPa压缩空气。
