这一时期，学校实验室重新搬回实验楼内过渡，由于实验器材暂时集中存放、无法展开，实验教学基本处于停顿状态。毕业实习也受到严重影响，部分学生不能安心实习，有些医院（如靠近地震灾区的徽县人民医院、成县人民医院）的实习生流失，后来经过检查整顿，实习基本恢复正常。(https://www.daowen.com)
2008年底，与天水市红十字会博爱医院、仁和医院签订了教学医院协议并挂牌。
