哈巴湖保护区荒漠生态系统主要具有净化降水水质、固定大气二氧化并释放氧气、清除大气有害气体和滞留粉尘、防风固沙4 类调节服务功能,包括净化水质、固碳、释氧、吸收大气污染物(吸收二氧化硫、吸收氟化物和吸收氮氧化物)、滞尘、区域防护(牧草增产和农作物增产)和固沙7 项评估指标。