病原学检查（直接查找致病微生物）

（1）涂片查看微生物：血涂片、痰涂片等，检出速度快，但容易漏诊.

（2）培养查找微生物：血培养、尿培养等.临床常用的是细菌培养，支原体、真菌培养相对较少，病毒培养难度较高，临床一般不采用.此类检查所需时间较长，阳性率较低.(https://www.daowen.com)

（3）检测微生物基因序列（也叫分子生物学检查）：高通量基因测序技术（NGS）、实时荧光定量聚合酶链反应快速检测（Xpert）、聚合酶链反应（PCR）等.此类检查较灵敏，标本中有极少量微生物即可检出；检测速度快，1～2天即可出结果.

检测标本类型对结果影响较大，原本应该无菌的部位，如血、脑脊液、骨髓等若检测到致病微生物，通常提示感染；人体部分脏器是与外界相通的，如口腔、气管、肠道等，这些部位原本就有大量微生物存在，这些微生物在正常情况下并不致病，只在免疫力低下或有伤口时才会导致疾病，这些部位的标本检测出的微生物不一定就是感染原因，需要结合症状、影像学检查结果、微生物类型等综合判断.另外，由于细菌进入血液会被免疫系统清除，所以血液中不会持续有细菌，而是一阵一阵地出现细菌，一次血培养阴性不能排除血液感染.