该船布置设计本着恢复郑和宝船原外貌，坚持实用、美观、舒适、方便的原则。船舶风格为仿古形式，设有落舱式甲板室。
在舱底0—28设29道水密舱壁，将主船体分为29个舱室，自尾至首依次为：尾部—0空舱、0—1为竹木炭舱、1—2为淡水舱、2—3为蔬菜舱、3—4为粮舱、4—5为桅舱、5—7为兵器库、7—9为货舱、9—10为桅舱、10—14为货舱、14—15为桅舱、15—17为货舱、17—18为家畜室、18—19为贡品收藏室、19—20为桅舱、20—21为货舱、21—22为赐品收藏室、22—23为淡水舱、23—25为兵器库、25—26为桅舱、26—27为竹木炭舱、27—28为桅舱、28—首部为锚缆舱。
下甲板的甲板室由于层高过高（4 m），更为了加大货舱容积，故先在舱室内铺一层货物，而士兵和水手居住在货物之上。从尾至首依次设有：尾部—0为操舵间和舵工居住室，0—4两侧为士兵居住室和高级船员居住室、中间布置厨房，5—7为客货舱（可作为士兵居住室），7—9两侧为客货舱（可作为水手居住室）、中间为大开口、开口周围布置活动栏杆，10—14、15—19、20—24为客货舱（可作为士兵居住室），24—25为客货舱（可作为水手居住室），26—27为客货舱（可作为钌手居住室）、中间为大开口、开口周围布置活动栏杆。5—7、23—24，中间以布帘的隔断横向进行分割，避免统舱过大。
主甲板的甲板室，从尾至首依次设有：尾部—0为阿班、斗兵居室、钌手居室和直库居室；0—6，左侧分别设鸿胪寺卿及侍卫长居室、书手居室、译字居室、买办居室、航行设备储物间、百户居室和总管居室；右侧分别设医务室、医官居室、火长居室、阴阳生居室、千户居室、百户居室和储物间；中部分别设正（副）指挥使居室和议事厅。6—25为露天甲板，其中部是3道主桅，中部自前而后设置长大的舱口，是人员上下通道和主桅安装施工的必要场地。25—27为水手居室和头锭居室，27—船艏为起锚舱。(https://www.daowen.com)
尾楼甲板的甲板室，从尾至首依次设有：尾部—3，左侧分别设侍卫室、神室和副使居室；右侧分别设厨房、餐厅和副使及将官餐厅；中部设郑和居住室、书房和中堂会客厅。3—5为进厅兼针房。
尾部露天甲板上设天妃宫，宫前设2旗杆。
宝船设9桅12帆。布置形式由首至尾依次列7道，共9桅，其中中部是3道主桅，首、尾露天甲板上各设2道副桅并各自分别向首、尾外倾，第2和第6道为双桅。
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