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1917年3月,受第一次世界大战的影响,中德两国政府断交,位于法租界的同济德文医工学堂校区被强行关闭,学校迁往吴淞,由华人接办,更名为私立同济医工专门学校,阮尚介受聘成为首任华人校长,但教务仍由德国教授负责,延续德国教育模式。1923年4月,学校正式更名为同济大学。1927年8月,学校成为南京国民政府确立的首批八所国立大学之一。1930年,医、工两科分别更名为医学院和工学院,快速发展。