一、命门火之根据
（一）古代哲学家和医学家的论述
1.《周书·洪范篇·河图辞》曰：“天一生水。”原文天一者指天上太阳的阳热之气，能够化生地下阴性的寒水之气，结合到《命火一元论》，此命火属阳属热，水属阴属肾，吾人累用温热补火的药，常能治好肾阴不足的病，即是证明，也能说明火药能化生真阴真水。补火药会伤阴伤水之论，只知其一，不知其二。
2.《易经·八卦辞》曰：“帝出乎震……劳乎坎。”新中国成立前，云南彭子益著《唯物论的系统医学》解云：“卦者，大气运动的现象之称，帝出乎震者，言上年夏时，太阳射到地面的阳热，经秋气之降，收于地面之下，经冬气之沉，藏于水中，到了今年春初之时，此阳热从水中升出于东方也。阳热为造成生物生命元素之原始，故称曰帝。……劳乎坎者，阳热由地面之上，降入地面下之水中，当慰劳之，便安静不轻动也。”清代郑庆安著《医理真传·坎卦诗》曰：“天施地润水才通，一气含三造化工。万物根基从此立，生生化化沭时中。”结合到《命火一元论》：帝出乎震者，从生理上讲，指命门火，出巡周身，从病理上讲，命门火出则为逼走，病属危急之证。劳乎坎者，坎属水属肾，从生理上讲，命门火出巡归来，应慰劳之；从病理上讲，要迎回命门火，发号施令，坐镇指挥，抵御外邪。故吾人常于阴邪盛的病证，驱使命火药，出巡出击，累获奇功；又常于命门火不潜，阳越于外之证，用扶阳收纳之剂，亦效若桴鼓。
3.《内经·素问·上古天真论》曰：“女子七岁，肾气盛，齿更发长。二七而天癸至，任脉通，太冲脉盛，月事以时下，故有子。三七，肾气平均，故真牙生而长极。四七，筋骨坚，发长极，身体盛壮，五七，阳明脉衰，面始焦，发始堕。六七，三阳脉衰于上，面皆焦，发始白。七七，任脉虚，太冲脉衰少，天癸竭，地道不通，故形坏而无子也。丈夫八岁，肾气实，发长齿更。二八，肾气盛，天癸至，精气溢泻，阴阳和，故能有子。三八，肾气平均，筋骨劲强，故真牙生而长极。四八，筋骨隆盛，肌肉满壮。五八，肾气衰，发堕齿槁。六八，阳气衰竭于上，面焦，发鬓斑白。七八，肝气衰，筋不能动，天癸竭，精少，肾脏衰，形体皆极。八八则齿发去。肾者主水，受五脏六腑之精而藏之，故五脏盛，乃能泻。今五脏皆衰，筋骨解堕，天癸尽矣。故发鬓白，身体重，行步不正，而无子耳。”肾气及天癸乃指生殖系统活的蛋白质及核酸，也就是“命门火”，这与人的生、老、病、死与生殖能力有直接的关系。
4.清代汪昂著《医方集解》说：“人之受胎，秉此火（指命门火）以有生”。庄子曰：“火传者，不知其尽也。”这段谈人生的源泉，命门火通过生殖系统传下去，生命永远不绝。
（二）国外资料对我的启示
1.恩格斯在《自然辨证法》中说：“生命是蛋白体的存在方式，这种存在方式实质上就是这些蛋白体的化学成分的不断的自我更新。”又说：“生命，从它的最低形式直到最高形式，都只是蛋白体的正常存在方式。”这些名言，对寻找命门火的实质问题很有启发。
2.1972年11月21日《参考消息》转载：“美英科学家埃德尔曼和波特同获今年诺贝尔医学奖金”报道这两位科学家在有关“抗体化学结构的发现”，提供了抗体结构的清楚照片和这组生物上重要的物质的作用方式。所谓“抗体是在抵御各种疾病的感染和发展中起重要作用的血浆蛋白质”。这个发现引起在免疫学的所有领域开展研究活动，在临床治疗方面产生了实际效果。(https://www.daowen.com)
3.1975年11月25日《参考消息》载《化学能转化为电能的生物学方法》一文中说：“在生物物质中存在着使化学能转化为电能的共同原理。科学家们证明蛋白质本身在积累电能。……蛋白质是分子发电机，但谁也没想到它们在动植物和人的机体中起着这样重要的作用。……蛋白质以电的形式积累的能，使用在机体的各种功能上，如呼吸、光合作用、消化等。”
这些成果证实了恩格斯：“生命是蛋白体的存在方式。”从“抗体—血浆蛋白质”及“蛋白质电能”的作用，可以推断出中医所谓命门火的物质基础之一，即命门火的实质组成部分，但非全部及主要部分，提供了中医命门火实质究竟在哪儿的可靠线索，将对中西医的发展产生影响。
4.科学院情报所1978年1月11～31日载：
（1）郑关林《现代自然科学正在酝酿新的重大突破》一文中说：“构成生物万物的最基本物质就是氨基酸和核苷酸。蛋白质由20多种氨基酸组成；核酸由四种不同甘酸组成。”
1953年，在生物学上出现了一次引人注目的重大突破——遗传之谜，发现核糖核酸是遗传的物质基础（DNA，是一种生物大分子）从而使生物学进入到第三发展阶段，即分子生物学的阶段。
（2）孙学琛《现代自然科学发展特点与组织管理工作》一文中说：“15世纪下半叶开始，几个世纪以来，有八个重大突破……（8）1953年遗传的迷——发现了核酸是遗传的基本物质，所谓遗传，原来就是通过核酸把特征密码（也叫基因或者叫信息）复制在子代的过程，是近二十多年来，自然科学上的一次重大突破。”
按：郑关林、孙学琛两先生介绍的生物学上的重大突破，生物体的最基本物质是蛋白质及核酸组成，尤其去氧核糖核酸（DNA），是生命的源泉，命门核心——命火秘宫就在这儿。