虽然某些病例粪便中可培养出细菌,少部分患者应用抗菌药也能够控制腹泻症状,但是经过多年的反复研究,并没有发现直接证据证明溃疡性结肠炎是由细菌感染引起的,同时以可能的细菌、真菌等进行实验性移植也没有获得成功,因此,溃疡性结肠炎的直接发病原因并不是细菌感染。