患者有以下几种情况时不宜做电子结肠镜。患者肛门、直肠严重狭窄，内镜进入困难；患者肛周脓肿、肛裂或者肛门有外伤；患者腹泻严重，出血量特别大时，应该等情况稳定后再做决定；怀孕的女患者；患者癌症晚期伴有腹腔内广泛转移；患者腹痛剧烈，难以忍受，深呼吸、咳嗽、转动身体时疼痛加剧，并波及整个腹部，出现恶心呕吐的症状；患者出现腹胀、双腿水肿、呼吸困难、恶心呕吐等腹水的表现时；有严重心肺衰竭，严重高血压，脑血管病，精神异常及昏迷的患者。
