3.DNA与核蛋白有密切的关系
虽然最近在大肠杆菌中发现有DNA、RNA和特殊蛋白结合的拟核体（nucleoid），但真核细胞中二者的关系要密切得多，DNA与蛋白构成染色质。根据最新的概念（Kornberg，1977），染色质的组成单位是核小体。核小体由组蛋白H2a、H2b、H3和H4各2个分子组成椭圆形的核心（50×110A），DNA双链（140个碱基对）沿着其短轴，盘旋于此核心上（见图5）。核小体与核小体之间由含15～100个碱基对的DNA链连接，此段DNA分子具有种族特异性，组蛋白H1和非组蛋白的酸性蛋白即附着在此DNA分子上。核小体串珠链受H1的影响，进一步盘旋成稳定的染色质超螺旋结构。当此结构松弛时，基因即可表达。除了组蛋白外，细胞核中非组蛋白的酸性蛋白也有重要的调节作用。DNA与这些特殊的蛋白质群的相互作用极强，对形态发生可能起主要的调节作用。据此，XecHH提出真核生物二种转录调节水平的假说：一级水平指染色质中DNA排列的紧密度，即染色质DNA的松弛原则上可决定某些基因的变化，但某些基因直接的活化要靠第二级水平——特殊的调节蛋白的调节。
