瓦屋墓地地层堆积较为简单,耕土下即为生土,墓葬均开口在耕土层下,打破生土,其原始开口层位已被历年农事活动所破坏。不过从有些墓葬填土中发现的新石器时代打制的石片石器以及一些陶片、瓷片来看,该地点原来的原始地层应该包含不同时代的文化层。