美国化学文摘数据库(SciFinder)
(一)数据库概述
SciFinder数据库(见图7-29)是目前世界上最大、最权威的化学化工文摘数据库,也是生命科学尤其是药学领域最重要的文献信息检索工具之一。它由美国化学会(American Chemical Society,ACS)旗下的美国化学文摘社(Chemical Abstracts Service,CAS)出品,是《化学文摘》(Chemical Abstracts,CA)的网络版。在充分吸收原书本式CA精华的基础上,利用现代机检技术,进一步提高化学化工文献的可检性和速检性,更整合了MEDLINE数据库、欧洲和美国等专利机构的全文专利资料,以及《化学文摘》1907年至今的所有内容。涵盖了应用化学、化学工程、普通化学、物理、生物学、生命科学、医学、聚合体学、材料学、地质学、食品科学和农学等诸多领域。可以通过网络直接查看《化学文摘》的期刊文献和专利摘要,以及八千多万条化学物质记录和CAS登记号。
通过SciFinder,可以访问由CAS全球科学家构建的全球最大并每日更新的化学物质、反应、专利和期刊数据库,无须担心遗漏关键信息;它还提供一系列特色的分析工具,便于用户检索、筛选、分析、决策,迅速获得研究所需的最佳检索结果,帮助研究人员在研究过程中更具创新能力和生产能力。

图7-29 SciFinder主页面
通过SciFinder可以检索CAS出版的6个数据库以及美国国立医学图书馆出版的MEDLINE数据库。
1.CAplusSM(文献数据库)
收录有化学及相关学科的文献记录4500多万条,包括19世纪早期至今的源自5万多种科技期刊(包括目前仍在出版的数千种期刊)的文献、63家专利授权机构的专利文献、会议论文、技术报告、图书、学位论文、评论、会议摘要、E-only期刊、网络预印本等。数据每日更新,对于全球9个主要专利机构公布的专利,保证其著录和摘要信息在公布两天之内收入数据库。每天新增超过5000条记录。可用研究主题、作者姓名、机构名称、文献标识号、期刊名、专利信息等进行检索。
2.CAS REGISTRYSM(物质信息数据库)
物质CAS登记号的权威数据库。包含超过1.3亿个物质,包括独特的有机物质、无机物质(如合金、配合物、矿物质、混合物、聚合物、盐等)及超过6700万条序列,是全球收录物质最多的数据库。用户可以通过化学名称、结构和CAS登记号(CAS Registry Number)对物质进行识别。CAS登记号是化学物质唯一的标识。
3.CASREACT(化学反应数据库)
可访问有关有机合成,包括金属有机、天然产物全合成及生物转化反应精确、可靠、及时的信息。目前收录了1840年以来的9850多万条化学反应,包括单步、多步反应及合成制备。记录内容包括反应条件、产率、催化剂、实验步骤等信息。可进行结构式检索或从物质/文献链接获取。
4.MARPAT(马库什结构专利信息数据库)
MARPAT记录116万余个可检索的马库什结构,来自1988年至今CAS收录的专利及1987年至今选择性收录的日本专利。此外,部分收录1984—1987年的英语专利和1986—1987年的法语、德语专利。其他1961—1987年的数据来自INPI(法国工业产权局)。2000年1月10日之后的俄罗斯专利和2008年至今的韩国专利也被收录在内。可显示超过479000篇含有马库什结构的专利信息。
5.CHEMLIST(管控化学品信息数据库)
查询全球重要市场被管控化学品信息的工具,目前收录34.8万多种备案/管控物质,覆盖1980年至今的名录及目录。
6.CHEMCATS(化学品商业信息数据库)
主要用于查询化学品供应商的联系信息、价格、产品纯度、库存等信息。记录内容还包括目录名称、定购号、物质名称、物质CAS登记号、结构式等。
7.MEDLINE(美国国立医学图书馆数据库)
主要收录生命科学尤其是生物医学方面的5600余种期刊、2300多万篇期刊文献,包括1946年至今的所有文献。
(二)用户注册及访问
1.数据库的系统要求
SciFinder数据库优选Google Chrome、Firefox以及Internet Explorer浏览器,Google Chrome和Firefox浏览器在所有系统上的表现又优于Internet Explorer浏览器;不建议使用360、搜狗等浏览器,因为会被自动拦截相关功能或插件。初次使用时,注意不要让浏览器拦截Other Sources等弹出的插件。
2.用户注册
使用SciFinder数据库必须先进行网络注册,建立个人的SciFinder用户名和密码。注册信息提交后系统将自动发送一个链接到用户所填写的邮箱中(注意查收垃圾邮箱等非正常邮箱),要求48小时内点击激活邮件中的确认链接,即可完成注册。若48小时内仍未收到激活链接,可再次注册。
要求必须在授权IP范围内进行注册并确认,否则系统会提示IP地址不在授权范围内;必须输入真实姓名和邮箱,First Name和Last Name信息的填写使用真实姓名的汉语拼音全拼;用户名必须是唯一的,输入规则为包含5~15个字符,可以包含字母或字母组合、数字和以下特殊字符:—(破折号)、_(下划线)、.(句点)、@;密码输入规则为必须包含7~15个字符,且至少包含以下三种字符:字母、数字、符号(如@、#、%、&)。
3.用户登录及访问
在购买机构的IP范围内,输入注册的用户名和密码即可登录,访问SciFinder数据库。(登录网址:https://scifinder.cas.org/)
(三)检索途径与方法
SciFinder数据库为用户提供了Explore References(文献检索)、Explore Substances(物质检索)、Explore Reactions(反应检索)三种检索方法。登录后,系统默认Explore Reference检索页面。
1.Explore Reference(文献检索)
提供Research topic(研究主题)、Author Name(作者姓名)、Company Name(公司名称)、Document Identifier(文献标识符)、Journal(期刊名称)、Patent(专利信息)、Tags(标签)七种途径。文献记录详情页面包括标题、摘要、文献中重要的技术术语、文献中重要的物质、书目信息、获得文献中的物质和反应、参考文献。
Research topic(研究主题),支持自由词检索,检索时要求在检索框内直接输入想要检索的能够代表研究主题的词,使用简短的英文描述检索的主要方面即可。系统不支持布尔逻辑运算符,建议在词与词之间的合适位置使用介词in、with、of等作为连接词,便于系统自动判断词间关系来转换成相应的布尔逻辑运算并进行预检索。预检索后可得到多个检索结果候选项,“concepts”表示对主题词做了同义词的扩展,“closely associated with one another”表示同时出现在一个句子中,“were present anywhere in the reference”表示同时出现在一篇文献中,用户根据检索要求选择合适的候选项,点击“Get References”可得到检索结果的文献列表。
Author Name(作者姓名),可输入作者的姓(Last nane)、名(First name or initial)或者中名(Middle name or initial)。系统规定必须输入作者的姓,如果不能确定作者的确切姓氏,可以勾选“Alternative spelling”(可供选择的拼法),在系统提供的可能的姓名形式列表中进行选择,选择正确的拼写形式后,点击“Get References”,检索所需文献。
2.Explore Substances(物质检索)(https://www.daowen.com)
提供Chemical Structure(化学物质结构式)、Markush(马库什)、Molecular Formula(分子式)、Property(理化性质)、Substance Identifier(物质标识符)五种检索途径。物质记录详情页面包括物质详情链接、物质文献链接、物质反应链接、物质供应商链接、物质管制信息链接、物质谱图链接、物质实验性质链接。
Chemical Structure(化学物质结构式)检索,多用于查找有机化合物、天然产物,支持精确结构检索、亚结构检索、相似结构检索。
Markush(马库什)检索,用于获取专利权利要求(说明书)中的Markush结构,确认化合物结构保护范围及获取最新化合物信息,可直接获得包含某通式结构的所有专利,可查找化学物质结构式检索检不到的专利,是化学物质结构式检索的重要补充。
Molecular Formula(分子式)检索,多用于查找无机物、合金,分子式输入需要遵守Hill排序规则。不含碳化合物,按元素符号的字母顺序排列;分子式为含碳化合物时,则“C”在前,如有氢则紧随其后,其他元素符号按字母顺序排在氢的后面。
Property(理化性质)检索,将物质的某一性质限定在某一特殊值或某一范围进行检索,包括实验数据、预测数据。
Substance Identifier(物质标识符)检索,物质标识符包括CAS RN和化学名称,化学名称可以是通用名称、商品名、俗名。
3.Explore Reactions(反应检索)
提供由化学物质结构作为反应物或产物的Reaction Structure(结构式反应)途径,常用获取方法有已知物质(由物质获取反应)、已知文献(从文献中获取反应)、精确结构反应检索、亚结构反应检索。可用图标来检索化学反应,并设定物质在反应式中的角色(反应物、试剂、产物或任何角色),用户也可以用反应位置工具和原子绘图工具做精确的反应检索。
反应记录详情页面包括反应详情链接、反应总览、反应实验过程、反应分组、反应排序、将反应推送到SciPlanner、反应分析与限定。
(四)检索结果的处理
SciFinder数据库对检索结果的处理除常见的可选择特定字段进行显示、保存、打印外,还提供了对检索结果进行进一步精炼、分类、分析等高级功能。
1.检索结果的显示
通过点击“Display Options”对结果显示格式及每页显示记录数目进行选择。系统默认部分题录显示(Partial Abstract)格式,还可以选择No Abstract、Full Abstract格式。默认每页显示20条记录,还可以改为15、25、50、75、100条。默认按入库时间由远到近排序,但是可以根据需求改变结果排序:文献检索结果可以通过收录号、作者姓名、被引次数、公开年份和题名进行排序,物质检索结果可以按照相关性、CAS登记号、报道物质的文献数量、供应商数量、分子量和分子式进行排序,反应检索结果可以通过收录号、实验过程、MethodsNow、反应步数、产率和公开年份进行排序。通过点击“Get Substances”“Get Reactions”“Get Related”可分别查看该化学物质相关文献、该物质参与的化学反应相关文献、包含被引用文献与引用文献的相关文献。
2.去重(Remove Duplicates)
由于SciFinder数据库包含多个子库,检索结果存在重复记录的可能,可通过“Tools”下拉列表选择“Remove Duplicates”,去掉重复记录,减少检索结果的文献数目。
3.分析(Analyze)
Analyze是重要的分析工具,提供12种选项,可将检索结果按照特定分析条件分为若干个子集,对检索结果进行统计分析。可分别对本领域研究人员、本领域研究机构、合作伙伴、竞争对手、期刊、涉及学科领域、相关索引词等进行分析。
4.精炼(Refine)
Refine是对检索结果的二次检索,提供7种选项,通过选择一个或多个限定条件,对检索结果进一步加以限定,使检索结果更加精炼,提高查准率。精炼条件包括Research Topic、Author Name、Company Name、Document Type、Publication Year、Language、Database。
5.分类(Categorize)
Categorize是学科分类工具,对检索结果按照学科领域主分类、学科领域副分类、索引词、选中的索引词等进行自动分类,便于用户进一步根据需要进行选择,优化检索结果,提高查准率。
6.检索结果的保存(Save)
点击右上角“Save”,可将检索结果保存在SciFinder服务器上,方便以后登录查看,每次可存1万条记录。保存时,要求给文件命名。完成保存之后,可在“Saved Searches”下拉列表中的“Saved Answer Sets”中查看。此外,“Saved Searches”中还可查看检索历史(History)。
7.检索结果的打印(Print)
点击右上角“Print”,选择所需结果记录,选择打印的格式,包括Summary without abstracts、Summary with partial abstracts、Summary with full abstracts、Detail(full record),也可以选择是否打印检索历史、标签及文件名称。
8.检索结果的导出(Export)
点击右上角“Export”,可将所需检索结果记录导出至本地电脑,要求给所导出文件命名。
9.全文获取
SciFinder是一个文摘型数据库,只提供文献的标题、摘要和索引部分,通过点击”Other Sources”,可以获得文献的全文链接。但是,只有用户所在的机构已经购买了该期刊的全文数据库,才可以直接链接到文献的全文。
(五)其他功能
1.SciPlanner
SciPlanner是组合和组织文献、物质和反应检索结果的工具,用户可以设计新的合成路线,并对反应、物质和文献做更科学的整合和管理。
在使用的过程中,先勾选想要的反应,点击“Send to SciPlanner”,在“Workspace”下新建一个文件夹,进入SciPlanner,将刚推送过来的反应拖到屏幕中间的编辑面板,点击反应中的一个物质,点击上面的双箭头,打开中间产物的标准菜单,选择“Synthesis this”,在检索到的反应中,选择感兴趣的一条反应,继续推送到SciPlanner中,再次将推送过来的反应拖到屏幕中间的编辑面板,可以看到两条反应中存在同样的结构,用鼠标将两个同样的结构拖动至重叠状态,两条反应合并,点击“Workspace”,选择其中的“Export”,输出结果。
2.Keep Me Posted
Keep Me Posted用于创建定题追踪。点击Create Keep Me Posted,系统将提示用户选择提示的频率(每周或每月)和其他参数。如果希望通过邮箱发送提醒信息,则点击页面上的Preferences,然后勾选查看Keep Me Posted下方的Receive e-mail notification of Keep Me Posted results。此功能是基于物质或者文献检索创建定题追踪,无法通过反应结构检索创建。