主要调查入河污染物指标为化学需氧量、氨氮、总氮和总磷4项。湖泊面源污染物产生量和入河量资料直接采用九大高原湖泊水环境保护治理 “十三五”规划（2016—2020年）成果。面源类型包括农村生活、农田面源、分散式畜禽养殖、水土流失、城镇地表径流5种。面源污染物入河量调查估算内容分为面源源强和流失量（或排放量）调查，入河量估算两个部分。调查方法一般采用产污系数法计算污染物源强，排污系数或流失系数计算污染物流失量或排放量，在污染物流失量或排放量基础上采用入河系数计算入河量。
