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广西民族医药研究所为自治区卫生厅、广西中医药管理局直属单位。1985年5月31日成立。1986年1月5日，设在由南宁地区人民医院改建的广西民族医院。当年6月11日成立的自治区卫生厅少数民族医药古籍整理领导小组暨办公室（简称民族医药古籍办），挂靠广西民族医药研究所。1987年1月5日，成立广西民族医药协会，挂靠在广西民族医药研究所。2月24日，广西民族医药研究所设立门诊部，对外开诊服务。

1988年1月8日，研究所创办《民族医药报》（试刊），1989年1月5日，正式创刊。

1990年，研究所拥有建筑面积8000多平方米的办公楼，干部职工130多人，其中高级科研人员9名，中级科研人员40多名，还有一批从民间考核招收的壮医、瑶医和苗医。设有壮医基础理论、壮医临床、瑶医、民族药、医史文献等10多个研究室，还开办临床验证部和培训部。临床验证部拥有50张病床和两个门诊部，培训部可同时举办两个短期民族医培训班。1992年有职工238人，其中有高级专业技术职称10人。1993年，研究所作为中国中医研究院的民族医药研究基地，加挂“中国中医研究院广西民族医药研究所”牌子。

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2002年8月，广西壮医医院成立，图为成立庆典现场

2002年8月，研究所增挂“广西壮医医院”牌子，实行“两块牌子，一套人马”管理。设门诊部、住院部、急诊科、壮医保健中心，拥有壮医目诊科、风湿病科、经筋推拿科等全国民族医药重点专科及壮医内科、壮医肿瘤科等自治区卫生厅重点专科，特色专科有瑶医科及苗医科等。运用壮医目诊、经筋推拿、药线点灸、药物拔罐、针挑、火功和割治、苗医药浴熏蒸、民族药等技法方药治疗各科常见病、多发病及疑难重症。

2005年9月，升格为正处级事业单位。广西民族医药研究所（广西壮医医院）为广西中医学院、右江民族医学院教学医院，中央企业及自治区直属单位、南宁市医保定点单位，国家中医类别中医（壮医）专业医师资格实践技能考试基地。自治区卫生厅民族医药古籍办、广西民族医药协会、壮医专业医师资格考试专家组办公室挂靠办公。有职工200多人，正高职称10多人、副高职称30多人、中级职称50多人。

1985—2005年历任所长：黄汉儒（1985—2001）、庞声航（2001—2005）