综合防治能力不足
防治措施有限，不能有效动员多部门开展防治工作，缺乏督导评估管理经验，难以形成好的工作局面和工作模式。大众对艾滋病的歧视现象仍很严重，艾滋病防治知识知晓率不高，低档娱乐场所FSW人群行为干预覆盖率、检测率不高，对MSM人群缺乏有效的干预措施，HIV感染者和AIDS病人的随访、干预与关怀任务重、难度大。社会组织规模小，能力不足，志愿者流动性较大。
（一）多部门参与力度不够
由于艾滋病对甘肃省乃至城关区经济发展没有造成太大的影响，有些部门认为艾滋病防治工作是卫生部门的事情，并没有将艾滋病预防工作纳入自身工作计划。卫生部门虽然在监测、预防控制、健康教育等方面做了许多工作，但鉴于艾滋病的特殊性，仅仅靠卫生部门难以全面完成艾滋病的预防与控制。因此提出了多部门合作的工作局面，但仍然存在着预防与控制艾滋病要靠卫生部门来做这种认识，有些部门未能主动按照条例中的要求完成本部门的工作任务。主要表现在艾滋病的宣传工作不作为，覆盖面不够广，在艾滋病的关怀、护理、医疗保障管理方面仍缺乏统一的安排，一些政策尚未完全落实。个别部门贯彻执行国家和地方法律法规不到位，主要表现在对艾滋病病毒感染者和艾滋病病人未能完全按照《艾滋病防治条例》和《关于对艾滋病病毒感染者和艾滋病病人的管理意见》中的有关规定进行管理。
（二）缺乏督导评估管理经验
城关区未开展过国家级示范区工作，虽然接触过中国全球基金艾滋病项目，但是在工作督导评估管理方面缺乏经验。督导与评估主要采取日常信息收集和现场检查。日常信息收集主要是通过艾滋病能够和防治信息系统，预防艾滋病、梅毒和乙肝母婴传播管理信息系统，结核病信息管理系统和传染病报告信息管理系统进行数据分析。根据重点工作的要求，查找可能的薄弱环节，对发现的问题及时进行整改。但是现场检查开展的较少，主要是现场检查医疗机构疫情报告，指导社区组织开展工作，涉及内容和活动形式比较单一。
（三）艾滋病歧视现象仍然存在
艾滋病不但给中国疫情严重地区的经济和社会带来很大影响，而且给整个社会的观念、医治、心理都带来很大的冲击。这种冲击在艾滋病进入中国的最初几年里，主要体现为人们对一种据说异常恐怖的、神秘的流行性疾病自发的恐惧，而后逐渐衍生出各种态度、感情和行为——从恐惧到逃避、排斥到憎恶、贬低，最后发展到主流社会对艾滋病患者的严重歧视。艾滋病相关歧视主要体现在以下领域：医疗卫生、就业、司法和法律、管理、社会福利、住房、教育、生育和家庭生活、保险和其他金融以及公共设施和服务等。例如，由于HIV感染者和AIDS病人被拒绝治疗、不知情检测HIV、招工时强制性检测HIV、强制性婚前检测HIV以及家庭、朋友、邻里间发生的种种歧视性态度和行为。对艾滋病的相关歧视普遍存在，中国的法律法规中基本上没有针对艾滋病的歧视措施。
艾滋病歧视的广泛存在，极大地制约了艾滋病防治工作的有效开展。政府领导歧视艾滋病，则会造成对艾滋病工作漠不关心、不予重视；易感人群不愿参与检测，造成艾滋病进一步传播；HIV感染者和AIDS病人害怕歧视而不敢向配偶、性伴透露自己的感染情况，从而加大了艾滋病病毒传播的危险。(https://www.daowen.com)
（四）针对高危人群干预有效手段有限
中国国务院原副总理吴仪，曾在全国艾滋病防治工作会议中明确提出“中国要坚定不移地推广有效干预措施”这一政策的同时，要坚决打击贩卖、吸食毒品和卖淫嫖娼的违法犯罪行为，大力推广使用安全套，积极开展在注射吸毒人员中进行的美沙酮维持治疗和清洁针具交换试点工作。中国现有HIV感染者约84万人，通过共用针具注射吸毒是艾滋病在中国传播的主要途径，同时经性传播的比例也逐年增长。哨点监测结果也显示，暗娼艾滋病病毒感染率呈增长的趋势。中国艾滋病疫情正处于由高危人群向普通人群大面积扩散的临界点。
对高危人群的行为干预是国际公认的、有效的艾滋病预防措施。但高危人群干预工作，也是艾滋病防治工作中的一个难点，由于卫生部门和公安部门对干预措施有不同的认识、城关区专业人员有限、同伴教育员队伍不稳定等因素，一直影响着高危人群干预工作的有效开展。
（五）HIV感染者和AIDS病人随访干预、关怀救助任务重大
城关区是兰州市的政治、经济、文化、科研、交通、商贸中心。城关区常住人口128万人，流动人口约50万人，辖24个街道办事处。城关区拥有42家综合医疗机构（其中民营21家），17家社区卫生服务中心和84家社区卫生服务站。2010年，城关区疾病预防控制中心负责随访管理的病例为200例，截至2013年12月底已经达到366例，增长速度比较快。城关区疾病预防控制中心性病艾滋病防治科共有8名工作人员，负责随访管理的工作人员仅有2名。艾滋病综合防治示范区工作一旦启动，随访管理相关工作指标不仅要达到考核要求，更要高于全省平均水平，进一步加大了随访管理工作的难度。
（六）社会组织能力不足，志愿者团队流动性大
艾滋病防治是一项涉及社会各方面的系统工程，需要社会组织在内的全社会参与。国内其他城市防治经验表明，社会组织参与艾滋病防治的作用是巨大和不可代替的。主要体现在社会组织更容易被公众接受，能较深入地接触到政府和一般机构难以触及的特殊群体，工作方式灵活，具有运作成本低、效率高的特点。社会组织在与工作对象接触、可接受性等方面有着明显的优势，可以与政府机构优势互补，促进防治工作的覆盖面和效果。目前城关区拥有社区组织4家，分别在HIV感染者关怀、MSM人群干预、暗娼干预和吸毒人群干预中发挥着重要的作用。但这4家社区组织存在的共同问题是，工作人员整体能力不足，志愿者团队建设处于初级阶段，人员流动较大，极大制约组织的可持续发展。