哈巴湖保护区下辖6 个管理站（高沙窝管理站、柳杨堡管理站、骆驼井管理站、哈巴湖管理站、城南管理站和二道湖管理站），涉及5 个乡镇（高沙窝镇、花马池镇、王乐井乡、青山乡和冯记沟乡）、30 个行政村、97 个自然村。保护区内有居民2714 户，总人口数为8269 人，均为农村人口，人口密度为9.84 人·km-2。
