交通运营干线
在开发区城区规划中有区域内专题交通蓝图。城市客运以公共交通为主导，形成地铁与公共汽车相配合的层次分明的公交体系，货运以社会化流通中心为基础，开辟区内货运专用通道，保证内外交通运输顺畅。不断完善道路网络结构，及时清除道路瓶颈，建立快速干道，增强城区辐射力、吸引力；建立交通控制系统，设置停车设施，提供必要服务。城市对外交通方面，着力改建提升公路等级，改造对外交通接口，合理布局城市对外交通设施，加强市内道路系统与南京主城及东山老城的衔接，注意主干道景观建设。1995年12月，开发区成立“南京利源客运公司”，开设开发区至市内火车站、码头、机场及各大宾馆的公交线路。还不失时机地加强与南京市市政公用局、江宁交通局的联系，争取南京公交、江宁区公交进入开发区。至2007年底，海陆空远近客货运营四通八达，已形成立体网络。
开发区地域附近的空港禄口机场、南京新生圩港、宁芜铁路、国道104、312、205、宁溧公路、地铁南延线等主要交通干线，本志其他章节已经述及，本节主要介绍公用交通及内河航运。
【市区至境内公交干线】
运行于江宁开发区境内的南京市公交线路，最初只有新东线（新街口至东山）途经河定桥，数十年中该线路十分繁忙，高峰时拥挤不堪。开发区启动区初步建成后，陆续有市区公交线路延伸进入，但初期多为惨淡经营。至2007年底，南京市公交线路已有十多条进入境，而且纵横交错，首尾相接，你来我往，客源众多。多条公交线路的起点站也设在境内。这样，从纵的方面加强开发区与中华门、新街口、鼓楼、河西、下关、火车站等闹市的密切联系。
【东山至区内公交干线】
开发区建设初期，江宁县（区）县城东山至境
内同样没有专线公交汽车，只有东山至东善桥、禄口等地的“过路车”经过宁溧公路。1996年起，江宁县公交除增加过路车外，相继开通多条直达开发区境内的公交线路，如到殷巷的区1路、到石马工业园的区2路、到河海大学江宁分校的区10路等，有的还开通了夜行公交车辆。循环运行的公交干线和穿越开发区境内的江宁区公交干线，大多从横向方面往来于开发区至东山老城之间，方便了两地人们的生活出行。
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穿境而过的机场高速公路
江宁开发区境内运行的市公交线路情况一览表 表07-05
开发区境内运行区公交线路情况一览表 表07-06
【秦淮河航道】
秦淮河古名龙藏浦、又名淮水，是一条古老的天然航运古道。三国东吴迁都秣陵（今南京），疏淮水，开运渎，截淮立埭，凿句容中道，沟通秦淮河至句容河至云阳中道（丹阳市西），直达太湖流域。明清时代，秦淮河航道仍是南京至溧水、句容等地的主要交通枢纽。近代汽车运输兴起后，秦淮航运方逐步萎缩，直至弃船搭车。1960年9月，建成武定门节制闸，秦淮河至入江口段航运彻底中断。1985年10月，秦淮河船闸建成，秦淮河通江航运得以恢复。流经开发区东部边界的秦淮河干流航道达到国家6级航道标准，水深维持1.5米以上，常年可供30—100吨船队航行。
秦淮河自江宁开发区河定桥往西，横穿开发区北部沿线即原岔路乡，经曹村桥、机场路桥和麻田桥（后改建为将军大道桥），再过雨花台区铁心桥、西善桥，由大胜关北金胜村而入长江。这一段人工开挖的秦淮河分支名叫秦淮新河，全长17公里。1975年开挖、1979年竣工、1985年10月河口船闸建成通航，结束了秦淮河因建武定门节制闸而造成断航的历史。秦淮新河河面宽150—230米，底宽30—68米；枯水期航道宽40—63米，深2.5—4.0米，曲度半径200—700米；为国家5级航道标准，可常年通航100—500吨级船舶。2004年船舶通过量为4万艘，载货量达700万吨。