王灵台主张辨证施治是中医临床的根本，强调治疗慢性肝病应辨证结合辨病。对证型重叠交杂者应分清主次，当无证可辨时，应遵循“有证辨证，无证辨病”的原则。肝病的发生和演变十分复杂，要考虑“病”和“期”的动态变化。对于临证用药，主张一法为主，多法联用。在治肝的同时，不忘和胃、益肾，时时注意顾护脾胃。对病情复杂者，善于处置治疗主要矛盾，灵活掌握药味和比重，做到“正邪兼顾，分清主次”。
