抗体重排基因（RAG）的无节奏出场

那么，现在的情况又是如何？

我们知道，在脊椎动物出现之后的某个时间点，它们分化成了两支。那么，在那个分叉点上，它们是否已经有了对抗原受体基因进行重排的能力？这是有可能的，但是另一方面，它的机制又是如此不同，以至于没人确切知道当时发生了什么。这两支后来都发育出了两种类似但又截然不同的重组系统。我们至今也不是很确定这是如何发生的，以及为什么会发生。一种可能是，这种重组的机制是多细胞生物应对病原体的最佳选择，但是我们已经看到，这也会带来像自身免疫病这样的问题。

之前有人提出了一个理论：在新的适应性免疫系统出现之前，有颌脊椎动物经历了一次类似宇宙大爆炸那样的演化过程，免疫系统迅速发展，在较短的时间里就出现了适应性免疫系统的所有组分。但是，现在看来这个理论站不住脚了。

我们可以确定的是，在5亿年前，我们祖先的免疫系统的确经历了一次大规模的、非常有趣的变异。在抗原受体基因重排机制的核心是一对叫作RG1和RG2的基因，它们可能造成了这次变异。这对基因只在有颌脊椎动物里出现；它们可能是从外界进入我们古老的祖先体内的，也许是作为病毒的一部分，然后它们碰巧进入了先天免疫系统基因内部，导致整个系统开始对基因进行剪切和重排。^[8](https://www.daowen.com)

你可能注意到了，随着故事的展开，我开始越来越多地使用一些限定性词语，比如“也许”“可能”。这不仅是因为在今天要弄明白5亿年间发生的事情本来就很困难，而且是因为这方面的研究才刚刚起步。时至今日，免疫学几乎总是以人类为中心；这并不奇怪，我们当然非常在乎自己的健康。相对而言，从演化的视角研究免疫还是一个较新的领域，这多亏了日新月异的基因组测序工具；有如此多的物种要研究，并且有如此多的问题需要回答，我们的确才刚刚开始。

不过，我们到现在还没有触及另一个巨大的话题：物种与体内微生物组的共演化。那些维持着复杂的适应性免疫系统的物种，同时也是那些承载复杂共生菌落的宿主。这是巧合吗？

无论巧合与否，七鳃鳗和盲鳗的免疫系统告诉我们，我们自己的适应性免疫系统也许没有那么特殊。