古代中医学有关命门实质的论述
1.《内经》关于命门之记载有二：
（1）眼睛：命门者目也。
（2）两肾之间：七节之旁，中有小心。
明代赵献可《医贯》说：“玩内经注文，即以心为主，愚谓人身别有一主非心也。谓之君主之官，当与十二官平等，不得独尊心之官为主。若以心之官为主，则下文主不明则十二官危，当云十一官矣，此理甚明，何注内经者睐于此耶？盖此一主者，气血之根，生死之关，十二经之纲维，医不达此，医云呼哉？或问心既非主，而君主又是一身之要，然则主果何物耶？何形耶？何处安顿耶？余日悉乎问也，若有物可指，有形可见，人皆得而知之矣，惟其无形与无物也，故自古圣贤，因心立论，而率不能直指其实。”我同意赵献可看法，人身别有一主非心，而是命门火。
2.《难经》曰：“左为肾，右为命门。命门者，精神之所舍也，男子以藏精，女子以系胞，其气与肾通。”《难经》直指右肾为命门。
3.晋代：王叔和《脉经》引《脉法赞》说：“肾与命门，具出尺部。”系继承难经，以右尺脉诊命门。
4.宋代：仍以《难经》左肾右命门为说：
（1）陈言《三因方》说“古人谓左肾为肾脏，其府膀胱。右肾为命门，其府三焦。”举三焦如脂，有二系上通于脑。
（2）严用和《济生方》说：“左为肾经，右为命门。”
5.金代：张洁古《脏腑标本寒热虚实用药式》云“为相火之源，天地之始，藏精，生血，降则为漏，升则为铅，主三焦元气。”继承右肾为命门之说。
6.明代：命门在两肾之间，为明代命门学说之主流：(https://www.daowen.com)
（1）虞搏《医学正传》说：“夫两肾固为真元之根本，性命之所关，虽为水脏，而实为相火寓乎其中，愚意当以两肾总号。”虞氏以两肾总号命门。
（2）张景岳《类经附翼》说：“肾两者，坎外之偶也，命门者，坎内之奇也。一以统两，两以色一，是命门总主乎两肾，而两肾皆属于命门。故命门者为水火之府，阴阳之宅，为精气之海，为死生之窦。”又说：“命门居两肾之中，即人身之太极，由太极以生两仪，而水火具焉。”又说：“命门为元气之根，为水火之宅。五脏之阴气，非此不能滋；五脏之阳气，非此不能发。”张氏取《易经》之理以论医，谓命门总主乎两肾，而两肾皆属于命门。
（3）孙东宿《赤水玄珠》说：“二五之精，妙合而凝，男女未判，两先生此二肾，如豆子果实，出土是时两瓣分开，而中间所生之根蒂，内含一点真气，以为生生不息之机，命曰动气，又曰原气，禀于生之初，从无而有。此原气者即太极之所以行也。两肾，静物也，静则化，亦阴之静也，此太极之体所以立也，动静无间，阴变阴合，而生水火木金土也。其斯命门之谓耶？”孙氏认为命门在两肾中，不过他以《难经》的动气作为太极，亦即命门。
（4）赵献可《医贯》说：“两肾俱属水，但一边属阴，一边属阳，越人谓左为肾，右为命门，非也。命门即两肾各一寸五分之间，当一身之中，《易经》谓一阳陷于二阴之中，《内经》曰七节之旁有小心是也，命曰命门，是为真君之主，乃一身之太极，无形可见，两肾之中是其安宅也。”又说：“命门为十二经之经主，肾无此则无以作强，而伎巧不出矣，膀胱无此，则三焦之气不化，而水道不行矣。脾胃无此，则不能蒸腐水谷，而五味不出矣。肝胆无此，则将军无决断，而谋虑不出矣。大小肠无此，则变化不行，而二便闭矣，心无此，则神昏而万事不能应矣，所谓主不明则十二官危矣。”又说：“其右旁有一小窍，即三焦，三焦者，是臣使之官，周流于五脏六腑之间而不息，名曰相火。其左旁有一小窍，乃真水也，亦无形，上行夹脊至脑中，为髓海，泌其津液。得之于脉，以荣四末，内得五脏六腑，亦随相火而潜行于周身。”赵氏与张景岳、孙东宿三人，均取《易经》之理以论命门，但以赵氏之说较为完备。
7.清代：以肾阴肾阳立说，即一水一火，肾阳即火，也就是命门火。
（1）黄宫绣《本草纲目求真》说：“火居两肾之中，为人生命生物之源。但人仅知肾之所藏在水，而不知其两肾之中，七节之间，更有火寄，吴鹤皋曰：此火行于三焦，出入肝胆，听命于天君，所以温百骸，养脏腑，充九窍，皆此火也，为万物之父，故曰天非此火，不能生物，人非此火，不能有生，此火一熄，犹万物无父，故其肉衰而瘦，血衰而枯，骨衰齿落，筋衰而肢倦，气衰而言散，此火衰之说也。”黄氏不谈《易经》之理称肾阳即命门火，特别强调命门作用，治法上提出补肾火，但须相其形症以施，不可一概妄投。
（2）何梦瑶《医碥·命门说》：“或问气即火也，血即水也，儿在胎中气血已具，是气血亦先天所生。六味补水，八味补火，是水火亦后天所养。今谓气血为后天，水火为先天，毋乃轻气血而重水火乎？曰，气血者，水火之大纲也。人身呼吸运动，不可以言知觉神明，皆此火之为之也。气可以言呼吸运动，不可以言知觉神明，是气虽即火而不足以尽火。人身之血液精髓，皆此火为之也，血特水中之赤者耳，不可以概其余。故血虽即水而不足以尽水。有生之物，胎孕始结，形如露珠，父母之精气也，是水火乃先天之先天。数月形成而后，血气俱足，是气血为先天之后天。若乎既生之后，饮食所养之气血，其为后天又不待言矣。”何氏说明重水火，轻气血不恰当，先天对后天固然有一定影响，但先、后天都有相互作用。
8.清代郑钦安《医理真传》坎卦解说：《易经》谓命门是“一阳陷于二阴之中”。可是，“历代注家俱未将一阳潜于水中底蕴搜出，以至后学昏然无据，滋阴降火，杀人无数，真千古流弊医门大憾也”郑钦安论命门特点为二：
（1）回复到明代，以《易经》哲理论命火，脱离不了时代的局限性。
（2）感慨时医误以虚火上犯（命火不潜），而用滋阴降火，杀人无数，确是卓见。