20世纪60年代，细胞毒理学提供了一大批生物检测方法，用以确认污染物产生的生物影响，如各种营养水平的生物毒性试验和遗传毒性试验。
20世纪80年代起，分子生物学的兴起，细胞毒理学的研究手段发生了革命性的变化，开始认识到污染物对细胞水平和亚细胞水平的损伤有很多是源于遗传基因的变化或损伤。
进入20世纪90年代后，基因定位、切割、DNA 重组等一系列的基因工程技术在生态毒理学中的应用与日俱增。
