太湖流域河湖生态系统面临的问题
从20世纪80年代中期开始，太湖流域社会经济进入快速发展阶段，人口和企业数量增加，建设用地急剧扩大，城乡建设蓬勃发展，农业化肥农药用量和畜禽养殖量快速增长，其他渔业、旅游业、交通运输业等对自然有重大影响的行业也发展得如火如荼，导致流域河湖自然生态系统承载了超负荷的环境和生态压力，人与自然的平衡系统被严重打破。
一、太湖湖体生态系统受损严重，存在生态灾变风险
从太湖湖体本身的情况来看，近15年来其富营养化水平在中度与轻度之间波动，2007年对太湖全面启动综合整治以后，总体水质得到持续改善，但总氮、总磷仍是控制难点，浓度水平存在不稳定特征，蓝藻水华暴发也呈现常态化，蓝藻控制成为流域治理需要长期努力的综合目标。而部分区域太湖底泥淤积较多，内源污染物释放贡献较大，沿岸大量河汊、渔港以及芦苇丛区域为水华的堆积腐烂提供条件，易形成“湖泛”等生态灾变。
另外湖体食物网结构简化，生物控藻能力降低。鱼类洄游通道阻隔和沉水植物大面积消失导致太湖鱼类种类大幅度减少。以浮游动物为食的湖鲚、银鱼产量达到总渔业产量的70%以上；对藻类摄食压力弱的小型枝角类和桡足类占有优势地位；而食藻型鱼类鲢、鳙产量逐年下降，不足总产量的5%，生物控藻能力减弱。总体来看，包括太湖在内的流域水生生物多样性低、结构单一，大型水生植物、鱼类、底栖动物均以耐污种优势群落为主。
二、太湖流域“生态圈层”功能退化，污染物拦截与净化能力下降
从陆地森林—湖荡湿地—河网系统—湖滨湿地所构成的流域生态圈层状况来看，太湖流域森林植被面积5000平方公里，只占全流域面积的14%—15%。近30年来面积保持稳定，常绿阔叶林是本区地带性植被，但由于长期以来受到人工干扰，原生植被已极少。本区的森林植被大多数恢复时间很短，水源涵养林结构不合理，生态系统比较脆弱，水源涵养和水土保持功能弱。
太湖流域湖荡湿地密布，总面积约1300平方公里，相当于太湖湖体面积的58%左右，在太湖流域污染物拦截和水质净化中发挥重要作用。近50年来，湖荡湿地数量与面积锐减，由于围湖利用而消失或基本消失的湖荡多达200个左右，面积高达400平方公里。受太湖流域城市化、水体高密度养殖、污染物排放增加等影响，现存的湖荡水体生态退化严重，湖荡湿地面积锐减，水生生物多样性全面衰退，污染物转化和拦截功能严重退化。
在河湖水系连通性方面，环湖水利工程对河湖水系自然生态的影响逐步凸显，各地防洪排涝建设的包圩和闸控体系，降低了河湖的水系连通性，人为控制了水位和流速流向，加剧了平原地区水体的缓流、滞留状态。
而太湖湖滨围湖造田与防洪大堤破坏了太湖湖滨带原有的湿地生态系统，太湖湖滨带开发利用强度过高，环境污染和生态退化加剧，湖滨带挺水植物分布面积锐减，缓冲带内生态破坏严重，湖滨带挺水植物分布面积不断缩小，尤其是太湖西岸及北部区域，原生态芦苇荡几乎消失殆尽，无法发挥近岸的生态系统净化功能，因此太湖综合治理以后，重建湖滨湿地成为一项重要的工程任务，2016年宜兴太湖近岸开始逐步试点恢复芦苇湿地工程。(https://www.daowen.com)
三、流域生态用地侵占严重，产业结构和发展模式不尽合理
太湖流域从土地利用状况来看，1985年至2010年耕地面积减少4354.04平方公里，同期建设用地增加了4248.23平方公里。后十年间耕地面积退缩速度明显高于前10年，为前10年的2.23倍，而建设用地近10年的增长量为前10年的3.2倍。大规模的城镇开发，不仅侵占耕地面积，也导致为耕地占补平衡，地方开发湖荡湿地作为农业用地，破坏原本的湖荡湿地生态结构。
在三产方面，太湖流域一二三产业GDP所占比例为3∶58∶39。第一产业比重逐年降低，第二产业占主导地位，第三产业发展相对滞后。第一产业内部种植业以传统种植模式为主，农田肥料投放量大，利用率低，氮磷流失严重；畜禽养殖业养殖模式不尽合理，排污严重。第二产业内部结构和布局不尽合理，传统高污染行业比重偏高。流域流动人口大量聚集，太湖流域人口密度高达1236人/平方公里，是全国人口密度的9倍，环境资源不堪重负。“十一五”以来太湖流域经济增长迅速，年均GDP增速超过15%，但经济增长模式仍未根本转变，产业结构不尽合理，造成湖泊流域生态环境承受巨大压力。
四、人为活动对太湖湖滨生态系统的影响
从人为活动影响类型来看，环太湖大堤工程对太湖湖岸带的湿地生态系统的影响是一个重要因素。我国1991年洪水过后，为增强太湖流域抵御特大洪水的能力，流域内实施了11项重要水利工程。在这11项工程中，环太湖大堤工程是一项重中之重的工程。在1999年大水检验中，该项工程发挥了极其重要的作用。然而，它对湖滨地带生态系统的破坏也是十分巨大的，由于大堤修建在正常蓄水位的岸边线上，因此正常蓄水位以上的岸滩生态系统基本上都被破坏。
此外，沿岸区域渔业养殖超常规发展加剧了湖滨带生态系统的退化。太湖渔业养殖始于上世纪80年代初期，上世纪90年代获得迅猛发展，目前，养殖几乎在太湖的沿岸地带均有分布。据调查，全太湖环湖大堤之内的养殖面积有0.73万公顷左右。由于草食性鱼类的捕食，使得养殖区水草无法生长，由于食底栖动物鱼类的捕食，使得螺、蚌等软体类底栖动物无法生长，而喜好有机污染物环境的底栖寡毛类和一些水生昆虫幼虫则迅速增加。因而，湖滨带的生态系统受到渔业养殖的超常规发展的显著影响。
旅游业的过度发展，也加速了太湖湖滨带生态的退化。太湖湖滨带具有丰富的旅游资源，在20世纪80年代以前的很长一段时间内，这种资源一直未被充分利用。改革开放以后，各个滨湖旅游区在开发建设的过程中没有对生态环境的保护引起重视，致使开发区的水土流失严重，破坏了原有的湖滨生态系统。另外，在发展过程中，也存在一个时期滨湖近岸管理不规范，度假区或农民农家乐产生的生活污水直接排入太湖，导致湖滨带水体受到污染，产生富营养化，使水生生态系统受到破坏。
