黄鳝自然栖息层的水深一般不会超过20厘米，这一特点源于其呼吸功能和身体结构。当黄鳝在摄食、运动以及气温较高时，必须以呼吸空气中的氧气为主，而其体内没有其他鱼类所具有的叫“鳔”的器官，因此，一旦水位过深，黄鳝必须靠消耗体力游到水表层呼吸，这显然不利于黄鳝的生长，所以黄鳝一般栖息于较浅的区域。但这一特点同时体现于多种方式，在水深区域，如果有密集的水生植物漂浮生长，则同样可供黄鳝栖息。
