三、国外工具检索

三、国外工具检索

工具检索是最简单的方法。国外最常用的工具检索和数据库如下。

(一)美国《医学索引》(Index Medicus,IM)

它是由美国国立医学图书馆编辑出版的大型综合性国际医学文献检索工具。创刊于1879年,是当前世界上最常用的综合性题录型生物医学文献检索工具。至1999年,已收录世界上70多个国家和地区、44个语种的3300多种生物医学及其相关学科期刊,其中我国出版的期刊有57种;每年文献报道量为30万余条;其中70%为英文文献。《IM》以题录形式报道期刊上的论文(Article)、编者述评(Editorial)、综述(Review)、著名人士传记(Biography)及含有实质性内容的讣告(Obituary)以及会议论文(Meetings)等英文文献。特点:①历史悠久;②收录范围广;③质量高,IM 的编辑出版等工作由“文献选摘评述委员会”的医学编辑及图书馆员各方面的专家完成;④检索简便(文献与索引合二为一);⑤回溯检索能力强(利用累积索引可检索到1879年)。

据统计,美国《医学索引》(Index Medicus/Medline/Pub Med)现收录中国期刊共103种,其中中国大陆出版的期刊86种,中国香港4种,中国澳门1种,中国台湾12种。

根据美国国立医学图书馆(National Library of Medicine,NLM)发布的“2008年版《医学索引》收录期刊名单”,《医学索引》2007年新收录中国期刊3种,为《病毒学报》、《神经科学通报》(英文版)和《针刺研究》。

根据笔者检索,《医学索引》2008年新收录中国期刊1种,为《世界儿科杂志》(英文版),其刊名尚未列入“2008年版《医学索引》收录期刊名单”,但在Pub Med中可以检索到该杂志2008年发表的论文。此外,由中国澳门国际中医药学会主办,英国Bi-o Med Central Ltd (BMC)出版的《中医学》(英文版),在Pub Med中可以检索到该刊自2006年创刊以来发表的论文,但其刊名未被列入“2008年版《医学索引》收录期刊名单”。

(二)美国《生物学文摘》(Biological Abstracts,BA)

它是由美国生物科学情报服务社编辑出版的大型文献性检索工具。创刊于1926年,收录了全世界90多个国家和地区用40多种文字出版的6300多种科技期刊。内容涉及生物学、农业科学和医学。目前,BA为半月刊,每年2卷,每卷12期。每半年以卷为单位出版卷累积索引。

1.编排与著录 根据生物学中的特点,BA 与BA/RRM 侧重从生物学角度进行存贮与检索,这是它不同于其他检索工具的地方,特别是类属索引。BA 由文摘和索引两大部分组成,BA/RRM 题录和索引两大部分构成。它们的索引种类完全相同,文摘的题录的编排与格式不同。

“目次表”(Section Headings):该表主要列出每期中所报道的内容。目次表中的学科名词和专门名词按字顺排检,目次后注的页码为该类文摘的起始页码。该表主要供逐期检索文摘之用。

“主题指南”(Subject Guide):实际上是“概念索引”的辅助工具。从1980年69卷起该“主题指南”只在每卷的第一期刊载一次。按主题词字顺排检,主题词下列副题词(学科名词、专用名词及普通名词),每一主题词下副题词著录内容如下。

(1)文摘号。

(2)著者姓名。

(3)著者所在单位及地址。右上角标有星号的姓名,表示括号内的地址,而不是其他著者的地址。

(4)文献出处,即文摘所摘录的原文的具体出处,包括期刊(图书)名、卷期号、页码、年份、收到时间等几项。

(5)文种,除原文为英文摘要的文章外,其他均注明原文文种。文种项目用方括号括起。

(6)文献标题。

(7)文献。

BA 的文摘是一种报道性文摘,字数为800~1200个字符,对常用术语多采用缩写词代替(全称见期末的缩写与代号表)。文摘的内容:研究目标;生物体的学名式通用名(特别是新的生物种类或新的分布);研究所用的材料、方法技术、仪器及预期效果;新的理论、术语、解释与评价;特效药和其他生化物等。

2.索引 BA 的索引具有品种齐全、形式多样的特点,均编有期索引和卷索引(半年度累积索引)。期索引附于每期文摘式题录正文之后,卷索引单独出版。从1985年起,期索引和卷索引均有4种类型:著者索引(Author Index)、生物系统索引(Biosystemmatic Index)、属种索引(Generic Index)和主题索引(Subject Index)。

3.查阅方法

(1)用主题索引查找:与题中有关的关键词有Depolymerisation(解聚),Viral-borne(被携带病毒),Endoglycase(心内聚糖酶)。

(2)从分类途径查找:先从Taxonomic Headings中确定该课题,一级类目为Viruses,二级类目为Bacterial Viruses,三级类目为Bacterial Viruses-General,主要概念可选Biochemistry(生物化学),再从Biosystematic Index 中可查得文摘号8742(BA-13)。

(3)由文摘号8742,查得文摘BA-3。

(三)荷兰《医学文摘》(Excepta Medica,EM)

它是由荷兰医学文摘基金会编辑出版的大型文摘性医学文献检索工具。创刊于1947年。它收录了世界各地的医学及相关期刊5000余种,分42个分册出版。EM 的每一分册由文摘和索引两大部分组成。文摘部分按其独有的分类法编排。收录全世界110个国家和地区的生物医学、药学及其相关学科期刊5400种,收录我国期刊22种(包括西安医科大学学报等);年报道文献量40万篇。EM 先后出版54个分册,现有42个分册(其中41个文摘分册,1个文献索引分册)。每年出1~4卷,每卷6~12期不等。从1989年开始制作光盘,到现在有17 个方面的内容。特点:文摘型检索刊物,文摘质量高;按专题分册出版;收录范围广泛,且偏重于欧洲、日本文献;卫生学、药学文献量大,无护理、口腔、兽医及心理学分册。

光盘版内容如下。

(1)Anesthesiology麻醉学。

(2)Cardiology心脏病学。

(3)Drugs and Pharmacology药物与药理学。

(4)Gastroenterology胃肠病学。

(5)Immunology and AIDS免疫学与艾滋病。

(6)Nephrology肾病学。

(7)Neurosciences神经科学。

(8)Obstetrics and Gynecology妇产科学。

(9)Pathology病理学。

(10)Psychiatry精神病学。

(11)Radiology and Nuclear Medicine放射与核医学。

(12)Ophthalmology 眼科学。

(13)Orthopedic Surgery 矫形外科学。

(14)Pediatrics儿科学。

(15)Dermatology皮肤病学。

(16)Rehabilitation and Physical Medicine 康复与理疗医学。

(17)Pollution and Toxicology污染与毒理学。(https://www.daowen.com)

(四)美国《科学引文索引》(SCI)

美国《科学引文索引》(Science Citation Index,SCI),由美国科学情报研究所(Institute for Scientific Information,ISI)编辑出版。1961年创刊,现为双月刊。1988 年SCI出版光盘,每月更新。SCI指来源刊为3700多种的SCI印刷版和SCI光盘版(SCI Compact Disc Edition,SCI-CDE),SCI-E(SCI Expanded)是SCI的扩展库。截至2019年6月,SCI-E 期刊数据库共有9211种期刊,可通过国际联机或互联网进行检索。收录期刊论文、会议摘要、通信、综述、讨论,以及选自Science,Scientist,Nature 中的书评等。包括生命科学、数学、物理、化学、农业等九十多个学科领域,其中医学是其重要报道内容;医学期刊占所有期刊的40%,侧重于医学基础学科的病理学和分子生物学。

1.SCI收录期刊的特点 收录40 多个国家中以英美两国为主,约占60%;英语期刊占大多数。中国2018年被SCI收录的杂志一共有197种,其中JCR 一区有50种杂志,其中5分以上的杂志一共有16 种。影响因子最高的是Cell Research 15.393。相比美国,2018年被SCI收录的杂志一共有2983种杂志,其中JCR 一区有1054种杂志,5分以上杂志共有382种,影响因子最高的是CA:A Cancer Journal for Clinicians 244.585,差距显著。

2.SCI的特点和作用 引文索引通过引文著者显示其论文被人引用的情况;来源索引中的团体索引从国家、城市名称出发,通过单位、科室名称显示该单位、该科室的论文著者发表论文的情况;以机构名称为线索,进一步深入显示其文献产生的情况。对引文的评价:通过引文索引显示被引论文产生的社会经济效益;对引文著者的评价:通过检索某引文著者的全部论文及论文被引情况,从而对该著者的专业特长和造诣及其对科技发展所做贡献做出客观的评价。在相近课题同行之间的桥梁作用:论文间的引证和被引证关系揭示了信息(情报)的交流与反馈,从而了解相同或相近课题研究者的分布和在同行之间架起了桥梁。对科研动态的分析作用:通过团体索引对大到国家,小到单位科室论文的统计分析,从而可以了解国家或单位科室的科研成就和科技发展动向,便于对口学习。

3.检索途径与方法

(1)利用引文索引(CI):欲了解或评价某学者的学术水平、科研成果、在某学科上所做的贡献及在国际上的知名度等,可通过CI查该专家的姓名及其论文被人引用的情况;某专家被人引用的论文越多,说明该专家在某学科中的造诣越深、所做贡献越大;某一论文被人引用的越多,说明这一科研成果发挥的作用越大,影响越大、社会效益也越大;引用该专家论文的引用著者(来源著者)越多说明该专家的知名度越高、越广;如果想获得自己研究领域更多更新的文献,可查该领域的知名专家,看其发表文献的情况及被引用情况,从而获得引用者(来源著者)的姓名及出处。

(2)利用专利引文索引(PCI):已知某一专利号,可以利用PCI查得其被引用情况,再从来源索引可查得具体引用文献的题目、出处等项目。

(3)利用来源索引(SI):这是利用著者姓名检索的方法,也是SCI中提供最详细文献信息的索引。从来源著者姓名可查得论文题目、合著者、论文出处、著者单位及非第一著者的文献,也可依据详细信息判断是否有重名的问题。

(4)利用团体索引(COI):利用团体索引可以了解某研究机构发表的论文和科研进展情况。

(5)利用轮排主题索引(PSI):这是以表达文献主要内容的名词或词组(关键次)进行检索的方法。

(6)综合循环检索:利用SCI提供独特的检索途径,以前面的查找结果作为新的查找起点,反复循环上述查找检索途径和过程,循环往复的追溯,从而查得越来越多的相关文献。

(五)《科学技术会议录索引》(ISTP)

创刊于1978年,由美国科学情报研究所编制,主要收录国际上著名的科技会议文献。它所收录的数据包括农业、环境科学、生物化学、分子生物学、生物技术、医学、工程、计算机科学、化学、物理学等学科。从1990-2003 年,ISTP 和ISSHP(后文将要讲到ISSHP)共收录了60 000个会议的近300万篇论文的信息。

(六)《工程索引》(The Engineering Index,EI)

创刊于1884年,由Elsevier Engineering Information Inc.编辑出版。主要收录工程技术领域的论文(主要为科技期刊和会议录论文),数据覆盖了核技术、生物工程、交通运输、化学和工艺工程、照明和光学技术、农业工程和食品技术、计算机和数据处理、应用物理、电子和通信、控制工程、土木工程、机械工程、材料工程、石油、宇航、汽车工程等学科领域。

(七)PubMed数据库

1.数据库概况 Pub Med数据库是美国国立医学图书馆附属国立生物技术信息中心(简称NCBI)开发的Entrez检索系统中影响较大的数据库之一。Entrez检索系统是一个整合了NCBI系列数据库中信息的检索工具,这些数据库包括MEDLINE、核酸序列、蛋白序列、大分子结构及基因组序等数据库。Pub Med数据库主要用于网上免费检索MEDLINE数据库中的期刊文献,也提供了对核酸序列、蛋白序列、基因组序列、分子结构、孟德尔遗传在线等数据库的链接。Pub Med数据库自1997年起向全球用户提供Internet免费访问,由于收录内容广泛、检索功能完善、使用方便快捷、更新周期短、链接功能强大等特点,成为目前国际上较权威的生物医学文献数据库。

2.数据库收录范围

(1)MEDLINE数据库:提供1966年以来70多个国家和地区的5200多种生物医学期刊的文摘或全文,内容覆盖了基础医学、临床医学、护理学等领域。文献记录的PMID字段有[Pub Med indexed for MEDLINE]标记。

(2)Old MEDLINE数据库:收录了1966年之前世界上重要的生物医学期刊文献记录150多万条,目前主要的为1945-1965年的数据,少量的已经回溯到1948年以前,文献记录没有摘要。PMID 字段有[Pub Med indexed for MEDLINE]或者[Pub Med Old MEDLINE]标记。

(3)Pre MEDLINE 数据库:一个临时性数据库,收录由出版商提供的未经规范化处理的文献条目数据,这些数据经标引加工后每周增加到MEDLINE 数据库,同时从Pre MEDLINE 数据库中删除。

(4)Publisher Supplied Citations数据库:出版商以电子版形式先将文献直接发送给Pub Med 数据库,这些文献记录后有[Pub Medas supplied by publisher]标记,该数据库每天向Pre-MEDLINE数据库传送文献记录。这些文献记录一旦被Pre-MEDLINE数据库收录,则改为[Pub Med in process]标记。

3.Pub Med数据库检索机制 Pub Med数据库设有词汇自动转换功能,在Pub Med数据库主界面的检索式输入框中键入检索词,系统将按顺序使用如下四种词表或索引,对检索词进行转换后再检索,见图1-11。

图示

图1-11 PubMed数据库界面

(1)主题词转换表:主题词转换表包括主题词、款目词、副主题词等。如果系统在该表中发现了与检索词相匹配的词,就会自动将其转换为相应的主题词,并将其与原来输入的词汇同时进行检索,词与词之间用OR 逻辑运算符连接。例如,输入cancer,系统执行的检索式为“neoplasm[MeSH]OR neoplasm[All Fields]OR cancer[All Fields ]”,如果输入的是词组,则系统除了进行主题词转换外,还会自动将词组拆分成单词进行检索,并以AND 逻辑运算符连接。

(2)刊名转换表:刊名转换表包括刊名全称,刊名MEDLINE形式的缩写和ISSN。该转换表能把键入的刊名全称转换成MEDLINE形式的缩写后,再进行检索。例如,在检索式输入框中键入:Advances in cancer research。Pub Med将其转换为“Adv Cancer Res”[Journal]OR(advances[All Fields]AND“in”[All Fields]AND “cancer”[All Fields]AND “research[All Fields]”)OR“Advances in cancer research”[All Fields]进行检索。

(3)短语表:短语表中的短语来自MeSH,含有同义词或不同英文词汇书写形式的统一医学语言系统和补充概念(物质)名称表。如果Pub Med数据库系统在上述主题词表和刊名转换表中未找到与检索词相匹配的词,就会查找短语表。

(4)著者索引:如果输入的检索词在上述的转换表中未找到匹配的词,且输入的并非单个单词,Pub Med就会在著者索引的相关字段[Author],[Full Author],[Full Investigator Name]中进行查找。输入作者姓名时,姓和名的词序不限,可使用逗号隔开(也可不用)。一旦使用逗号,则表示逗号前一定为姓氏。

若输入的词在上述各表或索引中均未找到匹配的词,Pub Med数据库会把短语分开,以单词为单位,分别重复以上的过程,各单词之间是AND 的逻辑关系。如果仍找不到相匹配的词,则将单词在[All Fields]字段中查找,各词之间是AND 的逻辑关系。

4.数据库检索途径

(1)基本检索:在Pub Med数据库的主界面的检索式输入框中,可输入单个或多个检索词(自由词、主题词、著者、刊名等)。也可输入包含逻辑运算符的检索表达式。如果词与词之间是AND 关系,无须用AND 连接,只需用空格连接即可。点击Search按钮或按回车键即可进行检索。

(2)高级检索:如果检索题目较为复杂,涉及多个检索词,多种检索字段,多种逻辑运算符,则可在主界面的检索功能区中单击advanced,进入高级检索界面,该界面各个检索词之间适用布尔逻辑算符,见图1-12。

图示

图1-12 PubMed数据库高级检索界面

(3)限定检索:如果希望根据出版日期、文献类型、语种、人类或动物、性别、子集、年龄、是否含摘要或全文链接等选项对检索结果进行限定,则可以在基本检索的结果出来后,在显示页面的左侧点击相应的过滤器链接,见图1-13。

如果需要更多的过滤器,可点击“show additional filters”链接。

图示

图1-13 PubMed数据库限定检索页面

5.检索结果的输出与管理

(1)检索结果显示:Pub Med数据库默认显示格式是题录格式,包括作者、标题、出处和PMID 号。如要选择修改,则可在任一检索结果页面的上方,在Summary、Per page下拉菜单,对显示格式、每页显示题录数量、排序进行选择。

(2)检索结果输出

1)题录下载:检索结果显示页面的Send to下拉菜单提供了多种保存方式。下载题录,先勾选所需的题录,如果不选,则默认为全选,然后在下拉菜单中选择欲保存的记录格式,最后在Send to下拉菜单中选择保存目的地。

2)相关链接:在任一检索结果页面右侧,Pub Med数据库提供了丰富链接,单击选full text link项可查找该文献全文。获取Pub Med数据库全文主要有以下三条途径,一是利用PMC,PMC目前有400余种生物医学期刊提供免费全文;二是利用检索结果的链接获取,在每条检索结果的文摘显示页面右侧出现有某个数据库全文图标,说明该篇文献有电子全文,检索者所在单位如已购买该数据库的使用权,则单击该全文图标就可以打开该篇文献全文;三是利用“Link Out”获取,同样是在检索结果文摘显示页面,单击记录后的Links链接,进入Link Out页面,这时系统链接到了Pub Med数据库外部资源,在“Full Text Sources”下列出了所有有关该篇文献的获取信息的链接,用户可自由选择。