关于meta分析的几个问题
今天收到一位年轻的同行来信询问关于诊断性试验meta分析的几个问题,可能有一定的代表性,特此将问与答记录下来。
仔细拜读了你2006年发表在Chest上的那篇关于IFN-gamma诊断结核性胸膜炎的文章[Jiang J,Shi HZ,Liang QL,et al.Diagnostic value of interferon-gamma in tuberculous pleurisy:a metaanalysis.Chest,2007,131(4):1133-1141],获益匪浅。我对诊断性试验的荟萃分析也比较感兴趣,但是无奈才疏学浅,至今未有成果,因此我冒昧地以这篇文章为例,请教施教授几个问题。如果施教授能从百忙中抽空为我解答疑问,学生不胜感激。
问:你在文中特别强调了以航空邮件或者email的方式联系文献的作者,获取研究的原始资料,但是有的作者并没有给你回信。在表2列举研究的特征时,你也将其标示为unknown,我不太理解的是:如果标注为unknown,在进行回归分析的时候如何赋值?此外,不知施教授能否惠赠一个电子邮件模板给我,让我学习学习如何与国外作者沟通,获取研究的原始资料。
答:文中已经注明将unknown视为no。以下是我使用索取其他资料的邮件格式:
Dear Dr.Who:
We are writing a meta-analysis manuscript entitled Diagnostic value of interferon-gamma in tuberculous pleural effusion:a meta-analysis.Of course,your paper (paper’s citation)will be included in the meta-analysis manuscript.
I would appreciate it if you provide me the following data:1)Was the study’s design cross-sectional?2)Was it consecutive or random?3)Was it blinded design?single or double blinded?4)Was the data collection prospective?These data are very important.The manuscript can not be completed without such data.
I am looking forward to hearing from you.Thank you very much.(https://www.daowen.com)
With my best regards Sincerely yours
问:施教授在表1中对研究进行了总结,其中列举了各个研究的cutoff值,敏感性、特异性等。有一个问题我不是很理解的就是:表1所列出的cut-off是否是全面衡量了诊断敏感性和特异性(约登指数最大)的最佳cut-off?因为cut-off直接影响诊断的敏感性和特异性。而有的诊断性实验,在公布cut-off的时候往往需要结合临床实际公布cut-off,比如,研究一种病情十分危重的疾病,显然应该适当牺牲特异性,以换取敏感性的提高。对于此类研究,如何选择cut-off值、敏感性、特异性等纳入meta分析?
答:表1所列出的cut-off值是各个研究原来使用的数值。你不需要做出选择,只要认真阅读原文,提取作者定下的cut-off值、敏感度和特异度资料即可。如果作者不明确给出敏感度和特异度的数字,你可以自己从散点图测算。
问:施教授在解释纳入标准时提到:A study was included in the metaanalysis when it provided both the sensitivity(true-positive rate)and the specificity (falsepositive rate)of IFN-gamma for the diagnosis of TPE,or when it provided IFN-gamma values in a dot-plot form,allowing test results to be extracted for individual study subjects。红字部分意思是不是说:有的研究可能只比较了结核性胸膜炎组和对照组,但是没有采用ROC曲线进一步进行分析。而你采用了ROC曲线对其进行分析,并计算出敏感性等指标后再将该研究纳入荟萃分析?我的理解是:如果对方是按照诊断性试验来设计论文的,那么可以进行ROC分析;如果对方仅仅是做了一个病例-对照(case-control)研究,以健康个体作为对照,则我认为不能用ROC曲线去进行分析。
答:大多数论文直接提供敏感度和特异度数值。你说的这个例子即使以健康个体作为对照,如果可以提取敏感度和特异度资料也可以用ROC曲线去进行分析。
问:还有一个不懂的地方就是你在文章中这样写到:In addition,for each study the following characteristics of study design were also retrieved:(1)cross-sectional design(vs casecontrol design);(2)consecutive or random sampling of patients;(3)blinded(single or double)interpretation of determination and reference standard results;and(4)prospective data collection.我理解cross-sectional design(vs case control design)就是横断面研究(与病例对照研究相比),我查阅了相关书籍(孙振球,徐勇勇主编,医学统计学,人民卫生出版社,2007:583-610),横断面研究是指现况调查,在短时间内收集数据,而回顾性研究则是回头从病例资料库中搜集数据,前瞻性研究是指先确定队列,之后对队列进行随访得出结论。诊断性试验多是采用横断面研究,你在文章所说的prospective data collection和prospective study有何区别?和cross-sectional design(vs case control design)是否矛盾?
答:你说诊断性试验多是采用横断面研究,回顾性的研究不符合实际情况,国际期刊发表的诊断性试验论文大多数是前瞻性研究。我们的系列meta分析论文从不纳入中文论文。prospective data collection和prospective study是一回事。cross-sectional design vs case control design不矛盾,一时不理解照搬就是。