绩效工资改革后,人员工资、职工保险、职业年金等支出增加了机构负担,部分基层医疗卫生机构收支存在较大差口,部分县(市、区)由于财力薄弱没有足额补助(如大英县对乡镇卫生院在编人员补助人均3万元/年、射洪市2.6万元/年、蓬溪县1.7万元/年),财政投入不足以缴纳“五险两金”,特别是医院自主聘用编外人员规模大(约占37%)、无财政保障,乡镇卫生院运转困难。