迎接教育部本科教学工作水平评估
根据教育部的规定，教育部计划2006年对学校进行本科教学工作水平评估，后来由于新校区建设等原因，推迟至2008年。尽管如此，学校丝毫没有放松迎评工作。
2005年2月27日，成立评估与建设工作领导小组、评建专家组、评建办公室等教学工作水平评估组织机构。3月2日，迎评办公室召开首次会议，讨论《南昌航空工业学院迎接教育部本科教学工作水平评估工作方案》以及关于评建工作的各项职责及有关工作的分工情况。
2005年10月24日，学校党委会决定，成立教学评估中心，负责本科教学评估的组织、协调等工作。11月10日，召开本科教学工作水平评估自评汇报会，评估建设工作领导小组成员听取各职能部门关于本科教学工作水平评估的自评汇报，对现存问题进行了逐项分析，并提出了进一步整改要求。12月30日，召开年度教学评建工作总结会，对该年度教学工作水平自评中发现的问题和拟整改措施进行了详细分析与探讨。
2006年3月14日召开评建工作会议，就“2006年教学评建工作整改任务与措施（草案）”进行研讨与修改，形成了2006年教学评建工作整改任务与措施的基本框架。
2007年4月18日，在原方案的基础上，学校颁布《南昌航空大学迎接教育部本科教学水平评估工作修订方案》，新方案强调在评建工作中，要重点抓好“五项工程”，即加大投入，抓好教学条件建设工程；合理规划，抓好学科和专业建设工程；抓好落实，实施人才振兴工程；更新观念，抓好教学改革和管理工程；全面整治，抓好育人环境优化工程。
2008年5月18日至23日，根据教育部的统一安排，以西北工业大学校长姜澄宇教授为组长、内蒙古工业大学原校长李含善教授为副组长的一行11位专家，对学校本科教学工作进行为期一周的整体考察。(https://www.daowen.com)
5月19日，学校召开本科教学工作水平评估汇报会。江西省人民政府省长助理胡幼桃、国防科工委人事教育司副巡视员孙莉、江西省国防科工办主任李贤书、江西省发展和改革委员会副巡视员王大同、江西省财政厅副厅长毛祖逊、江西省教育厅副厅长洪三国等领导，以及评估专家组全体成员出席。
在为期一周的考察评估中，专家组认真审阅了《南昌航空大学本科教学工作水平评估自评报告》，听取了余欢校长的本科教学工作汇报，查阅了相关支撑材料和原始档案，考察了大学物理教学实验中心、电工电子实验中心、工程训练中心、无损检测技术教育部重点实验室、轻合金加工科学与技术国防重点学科实验室、思想政治理论课教育教学研究中心、图书馆、室内体育训练馆、海军国防生培养基地、音乐厅、大学生活动中心、学生食堂和校外实习基地；察看了学生早上锻炼情况；参观了大学生工作成果展、艺术设计作品展，走访了材料科学与工程学院、环境与化学工程学院、航空与机械工程学院、电子信息工程学院、外国语学院、计算机（软件）学院、数学与信息科学学院、自动化学院、经济管理学院、体育学院、土木建筑学院、艺术与设计学院、思想政治理论课教育教学研究部、文法学院、音乐学院、海军学院等16个教学单位，以及党政办公室、党委组织部、党委宣传部、党委统战部、发展规划处、教务处、人事处、实验室与设备管理处、计划财务处、科技处、后勤管理处、后勤集团、基建处、图书馆、现代教育技术中心、学科建设与发展处、国际合作与交流处、学生工作处、团委、招生就业处等20个部门；随机听课31门次，调阅了18门课程的696份试卷及17个专业的691份毕业（设计）论文；进行了学生基本技能测试，分别考察了20名学生的英语口语能力、60名学生的计算机应用能力和15名学生的物理实验技能；先后召开了学校领导、老领导和老教师、学科负责人和骨干教师、青年教师、实验与实践教学教师、教学管理人员、学生、校友和用人单位等9个座谈会，共计100余名师生参加了座谈会。
在上述工作的基础上，依据普通高等学校本科教学工作水平评估方案，专家组经过认真研究和讨论，形成了对南昌航空大学本科教学工作水平评估的考察意见。专家组认为，在56年的办学历史中，南昌航空大学坚持以人才培养为根本任务，秉承“育人为本、质量立校、特色发展”的办学理念，负重奋进、勇于创新，培养了大量国家急需的应用型高级专门人才，为国家经济建设和航空国防事业发展作出了重要贡献。近年来，学校以科学发展观为指导，确定了符合自身实际的办学目标和定位，以“立足江西、面向全国、服务地方、服务国防”为己任，通过狠抓学科专业建设、师资队伍建设、教学质量管理和办学条件建设等工作，不断深化教学改革，办学条件明显改善、专业建设与教学改革成效显著、教学管理日益规范、人才培养质量稳步提高、学校声誉及影响力不断提升。学校抓住本科教学评建工作这一契机，认真贯彻落实“以评促建、以评促改、以评促管、评建结合、重在建设”的方针，扎扎实实开展了建设工作、自评自建工作，成效显著。南昌航空大学办学指导思想明确，本科教学中心地位突出；实施人才强校战略，大力加强师资队伍建设；办学条件全面改善，学校面貌焕然一新；专业建设成效显著，教学改革不断深化；教学管理严格规范，质量监控科学有效；全面推进素质教育，人才培养成效显著。
专家组认为，在56年的办学历程中，南昌航空大学始终坚持育人为本、德育为先的理念，以航空国防教育为载体，营造了独特的育人文化环境，不断推动大学生德育工作的创新和发展，为造就大批服务基层、敬业奉献的高素质人才奠定了坚实的思想基础；学校始终坚持知行合一、注重实践的理念，精心打造实践教学体系，形成了工程教学与工程训练相结合的教学模式，构筑了以国家级、省级实验教学示范中心为核心的实践教学平台，强化了大学生的综合工程能力训练，为航空国防事业和地方经济社会发展培养了一大批“上手快、能力强”的应用型高级专门人才，形成了自身人才培养的鲜明特色。
专家组建议，学校进一步加强师资队伍建设，加大学科专业带头人的培养与引进力度，继续加强青年教师培养，不断提高师资队伍的整体水平。专家组希望，江西省委、省政府与国防科工局一如既往地重视、关心和大力支持学校的建设，促使学校更好地发展，为国家航空和国防事业、为江西的经济建设和社会发展作出新的更大的贡献。
2009年1月15日，根据教育部《关于公布北京师范大学等87所普通高等学校本科教学工作水平评估结论的通知》，南昌航空大学获教育部本科教学工作水平评估“优秀”，标志着南昌航空大学本科教学水平上了一个新的台阶。