暂驻足衡山湘水
“长沙临时大学筹备委员会”成立后,梅贻琦即赴长沙进行筹备工作。1937年9月13日,筹备委员会正式举行第一次会议,决定7项任务,即校址之勘定、经费之支配、院系之设置、师资之遴聘、学生之收纳、建筑设备之筹置及其他应行筹备事项,并定于10月25日开学,11月1日上课。此后,筹备工作有条不紊地进行。
关于校舍方面,教育部与湖南省教育厅事先租定长沙韭菜园圣经学校为校舍。该校舍为美国教会所经营,校园清雅可观,教室内桌椅设备也颇完备,不足之处是全校仅有三层正楼1座、宿舍3座,无法容纳众多的师生。除正楼充分利用为教室及实验室外,宿舍仅能作为单身教职员宿舍,而男女学生宿舍无着。不得已,又租借附近的陆军第四十九标3座营房作为男生宿舍,借用涵德女校的1座楼房作为女生宿舍。工学院电机系和机械系学生全部寄宿于岳麓山湖南大学,借用该校设备和大教室上课。机械系航空工程研究班(11人)在南昌航空机械学校借读,实际上由清华大学航空研究所教授讲课。[4]化学工程学系学生则在重庆大学寄读,长沙临大派部分教授前往授课。因长沙校舍不敷应用,文学院设于南岳圣经学校分校,称长沙临时大学南岳分校。分校有教职员30余人,学生约200人。
关于行政组织与常委分工。长沙临大的行政组织,由筹备委员会的常务委员3人、秘书主任1人组成常务委员会,商决一切行政方针。蒋梦麟负责总务,梅贻琦负责教务,张伯苓负责建筑和设备。
为了分别办理各项事务,长沙临大还陆续聘请教授组成各种专门委员会,如课程委员会(负责各系课程的设置)、图书设计委员会(筹划购买全校所需要之图书)、理工设备设计委员会(筹划理工科所需之教学设备的购置)、教室宿舍设备委员会(筹划购置教室及宿舍有关设备)、国防工作介绍委员会(介绍学生参加国防服务工作)、贷金委员会(负责困苦学生的救济及发放贷金事宜)、防空委员会(负责防空工作)等等。
9月28日, “长沙临时大学筹备委员会关防”正式启用。
10月2日,根据常委会决议,临时大学对三校原有的科系进行调整,对原有的相关各系做了归并、调整,共设文、理、法商、工4个科,共计17个学系。
文科:中国文学系、外国语文学系、历史社会学系、哲学心理教育学系。
理科:物理学系、化学系、生物学系、算学系、地质地理气象学系。(https://www.daowen.com)
工科:土木工程学系、机械工程学系、电机工程学系、化学工程学系。

长沙韭菜园圣经学校
法商科:经济学系、政治学系、法律学系、商学系。[5]
学校从10月18日开始学生报到,原三校的学生24日注册截止,借读生到11月15日报到截止。10月25日,长沙临时大学正式开学。11月1日,学校正式上课,标志着长沙临时大学的全面运行。这一天,后来也作为西南联合大学的校庆纪念日。
当日,朱自清、闻一多、陈寅恪、冯友兰、金岳霖、潘光旦、吴有训、顾毓琇等一批教授来到长沙。上午9点多,日机来袭,空袭警报大作,大家实在无处可躲,所幸并未投弹,才免去人员伤亡。
临时大学开学之时,上海已为日军占领,常熟、吴县相继沦陷,不少教授阻于交通,来不及南下。北大的罗常培、罗庸、魏建功、郑天挺、陈雪屏、周作仁等直到11月17日才离开沦陷了的北平。而比他们先走多日的钱穆、贺麟、陈寅恪等,也同样于11月底才先后抵达长沙。因此,有些开设的课程暂时没有教授授课。学校在长沙正常办学仅一学期。至11月20日,全校共有学生1452人,教师148人。[6]
1938年1月24日至29日,临时大学举行了学期期末考试。1月底结束了第一学期的教学工作。原计划第二学期于2月21日在长沙开学。此时,宁沪相继沦陷,武汉告急,湖南局势日趋危急,抗战呼声高涨,已有一部分学生提前从军或去战地服务。局势危急,学校在长沙已不能久留。为了让学校能够继续办下去,必须选择一个比较安全的地方,准备开始有组织地迁移。常委会经反复研究,决定迁往云南省会昆明。