MRI由于可直接多平面成像并具有良好的软组织分辨率,能准确显示病变的范围,还可对一些病变作出鉴别,特别是肿瘤和炎症。MRI的流空效应可以直接显示血管,而反映出肿瘤内血管增多现象,如副神经节瘤及动脉瘤等其他血管性病变。牙内的汞合金及颅底皮质骨常在CT像上形成伪影而影响检查,MRI则无此缺点。MRI在鼻及鼻窦检查中最大的缺点是不能发现微细的骨改变,如骨增生、侵蚀和钙化。