1.“川产道地药材的形成及其资源合理利用与保护研究”获1996年国家中医药管理局三等奖。
2.“中药材三维定量鉴定及生产适宜性的系统研究”获2006年国家科学技术进步奖二等奖。
3.“道地药材形成机理研究及应用”获2011年国家科学技术进步奖二等奖。
4.“中草药物种DNA条形码鉴定体系”获2016年国家科学技术进步奖二等奖。