RNAi 应用于鉴定药物靶位和筛选药物方面。RNAi 的应用明显地缩短了从鉴定到认识药物靶基因功能的时间,有助于药物开发过程中对已知靶基因功能的高通量分析。Мak Imura 等利用RNAi 技术使丘脑下部一种豚鼠相关肽的表达量减少了50%。豚鼠相关肽使代谢率提高而不减少摄食量,从而减轻肥胖,为肥胖的治疗提供了一个靶点。