肠道感染细菌的微生物学检查和防治原则
（一）标本采集
1.粪便标本 对有腹泻、脓血便或水样便及长期发热患者，应于抗生素治疗前采集粪便标本。采集后的标本应尽快送检。如不能及时送检，则需将其置于50%甘油盐水中保存，但霍乱患者的粪便应于Caw-Blair液中保存。怀疑沙门菌感染者粪便的采集应于发病前的2～3周进行。
2.血液标本 对长期发热怀疑沙门菌感染及其他肠道细菌感染所引起的菌血症或败血症患者，应于抗生素治疗前采集血液进行分离培养或细菌鉴定仪测定。发热早期采集标本的分离率较高。菌血症及败血症者取骨髓标本的分离率较高。
3.脓汁标本 创伤感染及化脓感染灶中可分离到肠道杆菌，因此对伤口脓性物的初步鉴别是必要的。如脓汁是绿色有可能为铜绿假单胞菌感染，有异味或臭味者可能为厌氧菌感染。
4.尿液标本 在泌尿系统感染患者的尿液中常可分离到大肠埃希菌或变形杆菌。尿液标本的采集应取消毒中段尿。疑为沙门菌感染者的尿液应于发病的2～3周进行。
（二）分离培养与鉴定
1.分离培养 血液、脓汁、粪便和尿液标本的分离培养方法不同。血液标本通常需要增菌后再分离培养，脓汁标本可以直接分离增菌培养，尿液标本必须先离心再取沉淀物进行分离培养，三者均可选用琼脂平板或伊红亚甲蓝琼脂平板分离培养，而粪便标本必须采用选择鉴别性培养基分离培养。常用的鉴别性培养基有SS琼脂、伊红亚甲蓝琼脂和三糖铁培养基等。分离霍乱弧菌必须用碱性蛋白胨水或碱性琼脂平板培养基；分离副溶血性弧菌常用含3.5% NaCl的琼脂平板或SS培养基。
2.鉴定
初步鉴定：培养24小时后可从培养基上选出可疑菌落。肠道细菌在鉴别性培养基上的菌落特点是鉴别细菌的基础。如大肠埃希菌在伊红亚甲蓝琼脂培养基上形成紫黑色菌落，并有金属光泽；而沙门菌或志贺菌可形成无色半透明的菌落。
最后鉴定：肠杆菌各属细菌的最后鉴定，是根据生化反应的初步结果划分属范围，再根据诊断血清的凝集试验结果得出最后结论。用已知的多价血清或因子血清鉴定未知的临床分离菌株具有较高的实用价值。实验顺序应该是先选多价血清，如为阳性反应，再选因子血清。ELISA试剂盒和PCR等方法因准确性高、操作简便目前已被广泛应用临床检验。
（三）血清学反应(https://www.daowen.com)
因目前抗生素使用较为普遍，肠热症的症状常不典型，临床标本阳性分离率较低，故血清学试验仍有非常重要的辅助诊断意义。用于肠热症的血清学试验有肥达试验、间接血凝试验等，其中肥达试验的应用较为普遍。
肥达试验是用已知伤寒沙门菌菌体（O）抗原和鞭毛（H）抗原以及甲型和乙型副伤寒沙门菌的H抗原与受检血清作试管或微孔板凝集试验，测定受检血清中有无相应抗体及其效价，用以协助临床做出诊断。其结果必须结合临床表现、病程、病史以及地区流行病学情况综合解释。
（1）正常值：人群因沙门菌隐性感染或预防接种，血清中可含有一定量的相关抗体，且其效价随地区不同而有差异。一般是伤寒沙门菌的O凝集效价≥1∶80，H凝集效价≥1∶160；副伤寒沙门菌的H凝集效价≥1∶80时才有诊断价值。
（2）动态观察：抗体在发病后1周出现，以后逐渐增加。所以在疾病初期凝集效价可正常。有时单次效价增高不能定论，可在病程中逐周复查。若效价逐次递增或恢复期效价比初次≥4倍则具有诊断意义。
（四）防治原则
隔离和治疗传染源、切断传播途径和保护易感人群是控制肠道感染性疾病流行的三个基本要素。
对患者进行及时诊断和彻底治疗，对烈性传染病的患者还应采取隔离措施。由于一些消化道感染细菌对抗菌药物多具耐药性，因此抗菌药物治疗应在药物敏感试验的指导下进行，对腹泻病人应及时纠正水和电解质的紊乱。
切断途径也是控制肠道感染性疾病发生的主要手段之一。应加强粪便、水源和食品卫生的管理，加强屠宰业的卫生监督，禁售病畜肉类，完善肉类运输加工、冷藏等方面的卫生措施，防止病菌污染；注意对饮食加工人员和餐饮服务人员的卫生监督，严禁志贺菌、沙门菌的带菌者从事饮食服务工作。《中国药典》规定：口服药品（脏器药物）不得检出大肠杆菌和沙门菌。加强卫生宣传工作，培养易感人群良好的个人卫生习惯，不食不洁食物和不生食贝壳类海产品是预防消化道细菌感染的重要措施。
通过某些疫苗（如：伤寒Vi荚膜多糖疫苗）的使用以提高人群免疫力也可有效地控制相关疾病的发生。此外，为防止尿道感染，尿道插管和膀胱镜检查应严格无菌操作。