菅原道真怨灵作祟
直到藤原时平薨逝之前，菅原道真怨灵作祟的事情，都没有载入正史。《日本纪略》延喜十三年（913年）三月十二日条记载：
右大臣源朝臣光（即源光）薨，年六十八，号后西三条右大臣，狩猎之间，驰入泥中，其骸不见，有薨奏。
这位源光，在菅原道真被贬当天晋升为右大臣，他与藤原时平一起，是构陷菅原道真的主谋之一。由于这种死法过于离奇，当时开始有一部分人认为，这事肯定是菅原道真的怨灵作祟。
《日本纪略》延长元年（923年）三月二十一日条记载：
是日也，依皇太子（保明亲王）卧病，大赦天下。子刻，皇太子保明亲王薨，年二十一。天下庶人莫不悲泣，（中略）举世云：“菅帅（指菅原道真）灵魂宿忿所为也。”
延长元年（923年）四月二十日甲子，诏，故从二位太宰权帅菅原朝臣道真（即菅原道真），本官右大臣，兼赠正二位。宜弃昌泰四年（901年）正月二十五日诏书。
这位早逝的皇太子（保明亲王）娶的女御正是藤原时平的女儿。可见到了这个时期，之前只有一部分相信的“菅帅忿怨说”已经被大多数人所接受。所以，醍醐天皇不仅恢复了菅原道真的官职，还下诏追赠。
延长元年（923年）三月二十九日，醍醐天皇册立故皇太子（保明亲王）的皇子庆赖王为皇太子。然而，延长三年（925年）六月十九日，皇太子（庆赖王，不称皇太孙）又薨逝。之后，皇太子（庆赖王）之母（藤原时平之女）也离世而去，这实在是有点诡异。
不仅如此，藤原时平的其他子女也接二连三去世。《大镜》记载：
延喜九年（909年）己巳四月四日，藤原时平薨逝，时年三十九岁，担任大臣十一年，被称为“本院大臣”。
当时，藤原时平的女儿，女御（藤原仁善子）已经亡故，外孙皇太子（庆赖王）与长子八条大将藤原保忠都已经亡故。（中略）
藤原时平卧病时，进行了各种祈祷，还请人在枕边读《药师经》，读到“所谓宫毘罗大将”一句时，他总觉得是在读“所谓攻击我大限将至”，一直想着想着，竟成了癔症，不久就气绝身亡了。（中略）
藤原敦忠
大将藤原保忠的弟弟，中纳言藤原敦忠（藤原时平第三子）也去世了。这位藤原敦忠和歌作得极好，也十分擅长管弦之道。藤原敦忠去世之后，有一次，醍醐天皇游宴赏乐，源博雅三位原本有事不能参加（源博雅是琵琶的名手），醍醐天皇数次派人来请，说“今日的游宴开不下去啦！”后来源博雅出现了，一些宫中旧人感叹道：“哎，现在也是人才凋敝，朝中寂寥啊！以前藤原敦忠大纳言还在世时，若是游宴赏乐，谁会想到竟非得源博雅来侍奉天皇呢！”（中略）
藤原时平的子女之中，只有一位藤原显忠，是大纳言源升的女儿所生，后来升至右大臣。（中略）被称为“富小路大臣”。
藤原时平其余的子女，都三十多岁就英年早逝，没能活过四十。其中缘由，恐怕别无其他，就是因为北野之神（菅原道真）的怨念吧！（中略）
因为作恶构陷，所以藤原时平的血脉早早就断绝了。
就这样，菅原道真怨灵的故事在朝野上下传得沸沸扬扬。藤原时平的弟弟藤原忠平接替兄长成为大臣之后，心中越发恐惧，渐渐生出悔意，于是，悉数赦免了菅原道真的子女，并让他们官复原职，一心致力于平息菅原道真的怨念。
然而，延长八年（930年），又有大雷电，《日本纪略》记载：
延长八年（930年）六月，雨不降。延长八年（930年）六月二十六日戊午，诸卿侍殿上，各议请雨之事。
延长八年（930年）六月二十六日午三刻，从爱宕山上，黑云起，急有阴泽。俄而雷声大鸣，堕清凉殿坤第一柱上，有霹雳神火。侍殿上之者，大纳言正三位兼行民部卿藤原朝臣清贯（即藤原清贯），衣烧胸裂夭亡，年六十四。又从四位下行右中辨兼内藏头平朝臣希世（即平希世），颜烧而卧。又登紫宸殿者，右兵卫佐美努忠包，发（头发）烧死亡。纪荫连腹燔闷乱，安昙宗仁膝烧而卧。民部卿（藤原）清贯朝臣，载半蔀，至阳明门外载车。（平）希世朝臣载半蔀，至修明门外载车。时两家之人，悉乱入侍。哭泣之声，禁止不休。
当时，世人把这也当作菅原道真怨灵作祟，因为藤原清贯和平希世等都参与了策划构陷菅原道真。