藤原时平等薨逝
菅原道真由于藤原时平等人的谗言构陷，惨遭贬谪，没有等到赦免，死在流放之地。藤原氏之外的一些人，对菅原道真蒙冤被贬的遭遇深表同情，也为他的郁郁而终而悲叹。纷纷议论将来定会有祸事。在当时那种迷信的年代，大家深信不疑，一传十，十传百，慢慢变成了公开的秘密，终于也传到了藤原时平等人的耳中。《大镜》记载：
菅原道真成了北野之神，起了大雷电，落在清凉殿。藤原时平拔出太刀，大声威吓道：“你在世之时，尚且居我之下，现你虽已成神，却非此世之人，为何还要如此？”
雷电一时间安静了。（中略）不过，大家都说，这不是因为藤原时平的威慑，而是皇家威严的震慑。
这件事的具体年代，已不可考。不过，延喜三年（903年）六月开始，连续干旱了数十日，各地神社纷纷作法求雨。到了延喜三年（903年）七月中旬，又连续数日狂风暴雨、电闪雷鸣，于是，各地神社又开始作法祈求停雨。
次年，即延喜四年（904年）四月七日，雷电震动紫宸殿及其他各处。延喜四年（904年）七月、八月，每天都有雷雨。当时的人们都认为雷雨是菅原道真的冤魂作祟。
延喜五年（905年）八月十九日，开始有人在太宰府安乐寺为菅原道真建庙，供奉美酒，希望能抚慰菅原道真的亡灵。
然而，延喜六年（906年）四月，连续数日狂风暴雨、电闪雷鸣，还降下冰雹，冰雹足有杨梅那么大。一时间京中水流成河，无法通行，人畜死伤无数。于是，醍醐天皇命延历寺法性房僧正尊意进行停雨祈祷。醍醐天皇前后下了三道圣旨，最后甚至要求尊意入宫作法。可见当时雷雨灾害的严重。
延喜八年（908年）十月七日，参议藤原菅根去世。当天，雷雨大作，当时人们都传言，是菅原道真显灵收了他的性命。
次年，延喜九年（909年）四月四日，藤原时平去世，时年三十九岁。藤原时平因为一直与菅原道真作对，所以被民间称为“愚物”，其实并非如此。藤原时平颇有诗才，《菅家文草》中收录了菅原道真与藤原时平的和韵之作。而且，藤原时平还拥有非凡的政治才能，从下面一件小事中可以略知一二。
延喜年间，朝廷下令，严禁公卿及以下穿着美服华饰。但由于奢靡之风由来已久，朝廷的禁令一时之间没有奏效。当时，醍醐天皇一心想要遏制这种不正之风。有一天，藤原时平穿了一件非常华美的衣服进宫面圣。醍醐天皇坐在御座之上，从御座与大殿之间隔断上的小窗中看见了，立马就变了脸色，立刻命随侍的官员传旨：
“现在朝廷严禁穿着美服华饰，左大臣今日为何穿着如此华美？虽然你有官职在身，但以身犯禁，亦不可赦免。今日不许上朝，速速退出。”
藤原时平听到传旨，惊恐不已，赶紧退出宫廷，回到家中闭门思过。有人到府拜访，藤原时平也因戴罪之身，不敢见客。
听说这件事的人暗暗思忖：连左大臣犯了服饰之禁，都要遭受这么严厉的谴责，如果是自己犯了禁，不知道会被怎么处罚。大家心下戚戚，于是，浮华之风很快停了下来。
《大镜》等记载，其实这件事是醍醐天皇与藤原时平秘密商议好的。可见藤原时平深谙权谋之道。
设计构陷菅原道真，也是藤原时平玩弄的权术手腕。当时，不止菅原道真，菅原道真的女婿斋世亲王也于同年，即昌泰四年（901年）在仁和寺落发出家。由此可见醍醐天皇震怒之深。不过，关于斋世亲王的出家时间，《日本纪略》等记载的是延喜五年（905年），《东寺长者补任》中记载的是延喜元年（901年）二月二日，《本朝皇胤绍运录》中记载的是延喜元年（901年）十二月，可能误加了“十”字。