天元大火及官人盗贼
天元三年（980年）十一月二十二日，贺茂临时祭举行。当天，宫中正在宣读圆融院给贺茂神社的宣旨时，主殿寮突发大火，火势蔓延甚广，只有采女町、御书所、桂芳坊等几处宫殿幸免于难。
众人护卫圆融院避难，先是移驾至太政官僚，后来火势蔓延到采女司厅，于是，圆融院又移驾到藤原赖忠四条坊门的府中。随后，按例裁减天皇御服、御膳等，并减免各国未进的调庸，并免除各国一半徭役。又因为新建宫舍，减免全国田租一半。各节会等全部停办。
天元四年（981年）七月，新造皇宫立柱上栋。
天元四年（981年）十月二十七日，圆融院迁回新宫。
天元五年（982年）五月，皇后（藤原遵子）、皇太子（师贞亲王）迁回新宫。后来，朝廷在皇宫内修行“不断读经法”五日，以祈求皇宫平安。
然而，天元五年（982年）十一月十七日夜晚，皇宫内又起大火，各宫悉数烧毁。《日本纪略》记载：
（大意）天元五年（982年）十一月十七日寅时，皇宫起火，众人匆匆护卫天皇（圆融院）避难。随侍之人都来不及穿戴整齐，大臣等着布袴[10]相从，诸卫官人则穿乌帽子布衣。
可见当时匆忙之状。
随后，圆融院、皇后（藤原遵子）、皇太子（师贞亲王）移驾至堀川院。
宫中连续失火，明显是盗贼故意纵火。前文中说到，这些盗贼之中，也有诸卫的官人。早在天元三年（980年）九月，就有一个名叫藤原景澄的春宫带刀侍卫，进入弘徽殿曹司盗取财物。天元五年（982年）六月，有盗贼在式乾门宿值所盗取财物并放火。此外，还有人在皇宫重建期间放火。连皇宫大内尚且如此，其他地方就更不必说了。
天元三年（980年）十二月，强盗数十人袭击但马守藤原尧时的住宅，掠夺财物，还在中纳言藤原重光的一条大宫府邸、右大臣藤原兼家的东三条府邸放火。于是，朝廷命检非违使逮捕京中、畿内没有武职却携带弓箭之人，并处以杖刑八十。
当时，有个名叫左兵卫尉藤原齐明的人，用兵刃伤了播磨介藤原季孝和弹正少弼大江匡衡之后逃跑，后在近江国高岛郡被前播磨掾惟文王捉拿。藤原齐明与其弟散位藤原保辅集结盗贼之事败露，藤原齐明被斩首示众，藤原保辅被捉拿下狱，死在狱中。
大江匡衡
总之，当时各国连年歉收，京畿地区尤甚。《日本纪略》说“此间米值腾跃，饥渴之甚也”。平民百姓苦不堪言，而贵族阶层却依然骄奢淫逸，这也是盗贼横行的重要原因。
由于皇宫再次失火，加上当时旱灾频发，于是，次年（天元六年，即983年）四月，改年号为永观。
永观二年（984年）八月，圆融院在临时皇居堀川院中让位于皇太子（师贞亲王）。宽和元年（985年），圆融上皇落饰出家。正历二年（991年）二月，圆融上皇驾崩，时年三十三岁。圆融上皇的遗体在圆融寺北原火化后，葬于村上山陵。