一、疫病及私斗
一条院登基之后，灾异频发。其中，最严重的莫过于疫病。《日本纪略》记载，正历五年（994年）正月至十二月，疫病暴发，从镇西（九州）到七道，疫民遍地。关于京都的状况，《日本纪略》正历五年（994年）四月二十四日条记载：
被下官旨云，京中路头病人甚多，宜令安置之。
正历五年（994年）五月十六日条记载：
左京三条南油小路西有小井，狂夫云：“饮此水之者，可免疾病。”仍都人士女，举首来汲。
正历五年（994年）五月二十六日条记载：
依宣旨，诸司诸家起石塔，依救疾疫也。今日，即正历五年（994年）五月二十六日，被行大赦，依疾病也。
正历五年（994年）六月十六日条记载：
公卿以下，至于庶民，闭门户不往还，依妖言也。
这就是当时那种迷信年代应对疫病的方式。
正历五年（994年）六月二十六日，朝廷修御灵会，以消除疫病。木工寮、修理职建造神舆两驾，置于北野船冈。然后请僧人来讲《仁王经》，并请伶人奏乐。京城中男女老少，不计其数，纷纷涌来进献币帛。礼拜完成之后，神舆被送到难波海上，希望能将祛除疫病的祈祷送到边缘之地。
在正历五年（994年）四月到七月之间，京中死者过半，五位以上官员去世之人多达六十七人。
次年长德元年（995年）五月条记载：
今年（长德元年，即995年）四五月，疫疠殊盛，中纳言以上薨者八人。
长德四年（998年）七月条记载：
今月，即长德四年（998年）七月，天下庶众，烦于疱疮，世人称之为稻目疮，又名赤疱疮。天下无人免于此病。
长德四年（998年）十二月条记载：
今年（长德四年，即998年），天下自夏至冬，疫疮遍发。长德四年（998年）六七月之间，京师男女，死者甚多，四位以下人之妻尤甚。始自主上，至于庶人，上下老幼，无人幸免。
长保三年（1001年）记载：
自去冬至今年（长保三年，即1001年）七月，天下疫死大盛，道路死骸，其数不知，况于殓葬之辈，不知几万人。
长保三年（1001年）五月九日条记载：
于紫野祭疫神，号御灵会，依天下疾病。神殿三宇、瑞垣等，为木工寮修理职所造。御舆，为内匠寮所造。京中上下，多以会集，号之今宫。
类似的法事、祈祷等频频举行，却毫无效验，而祭祀等迷信活动却愈演愈烈。祈祷修法的流行，导致僧侣暴富，其弊端便是僧徒变得更加跋扈，动辄对抗国司，甚至来到京城强行申诉。
而疫病、凶歉的流行，也导致国力衰颓，盗贼横行；各地豪族四起，对抗国司，私斗频繁。其中，下野守平维衡与其同族平致赖之间的私斗，延绵数月。于是，长保元年（999年），朝廷下令，将平维衡流放到淡路，将平致赖流放到隐岐。
此外，藤原致忠杀害前相模守橘辅政之子，被处流放佐渡；平维茂与泽胯四郎诸任（藤原秀乡的子孙）因为庄园地界的问题发生争斗，平维茂杀害泽胯四郎诸任后逃逸；宽弘四年（1007年），大隅守菅野重忠归京途中，于太宰府被大藏满高杀害；因幡守橘行平与因幡介藤原千兼发生私斗；等等。类似事件层出不穷。