8.3.2 结果
（1）PPI网络构建结果
利用在线工具STRING，我们对CACNA1C和三个ITIHs家族蛋白进行蛋白质互作网络分析，利用cytoscape软件进行网络构建，结果如图8-20所示。该网络图中共包含了48个节点、147条边。通过网络图我们可以发现，CACNA1C蛋白与ITIH家族中的ITIH3蛋白直接相互作用，而ITIHs家族的三个蛋白能够直接或者间接地构成蛋白互作网络。
（2）功能富集分析结果
对网络中的48个蛋白使用DAV ID在线工具进行功能富集分析，其结果如表8-21所示（每个分类我们取前十个结果，所有的结果参见附表一、二）。
通过表8-21，我们可以发现，CACNA1C蛋白的功能主要集中在以下几个方面：
①离子转移生物学过程：GO：0006816～calcium ion transport，GO：0006812～cation transport，GO：0006811～ion transport。
②离子通道复合物细胞组成：GO：0034704～calcium channel comp lex，GO：0005891～voltage-gated calcium channel com p lex，GO：0034703～cation channel comp lex。
图8-20 CACNA1C蛋白与ITIHs家族相关的蛋白互作网络图
注：原彩色图中红色节点为CACNA1C蛋白与ITIHs家族蛋白，粉色节点为与这四个蛋白相关的互作蛋白。连线表示蛋白相互作用关系，连线越粗表示蛋白互作得分越高，结果越可靠。
③离子运输蛋白质功能域：IPR005821～Ion transport，IPR002077～Voltage-dependent calcium channel，alpha-1 subunit。
④信号通路：hsa04020～calcium signaling pathway，hsa04010～MAPK signaling pathway，hsa04912～GnRH signaling pathway。(https://www.daowen.com)
ITIHs家族蛋白的功能主要集中在以下几个方面：透明质酸代谢过程（GO：0030212～hyaluronan metabolic process），黏多糖代谢过程（GO：0030203～glycosam inoglycan metabolic process），氨基聚糖代谢过程（GO：0006022～am inoglycan metabolic process），多聚糖代谢过程（GO：0005976～polysaccharide metabolic process），细胞外基质区组成（GO：0005576～extracellular region），酶抑制剂激活（GO：0004857～enzyme inhibitor activity），参与A型血管性血友病因子的结构域（IPR002035～von Willebrand factor，type A）。
表8-21 48个相互作用的蛋白功能富集分析结果
（续表）
注：第一列Category代表富集功能分类。BP代表生物学过程，CC代表细胞组成，MF代表分子学功能；INTERPRO代表蛋白质功能域；KEGG PATHWAY代表KEGG数据库的生物代谢通路。Count代表富集的基因个数。P Value代表超几何分布的P值。
（3）文本挖掘结果
利用Perl语言进行文本挖掘，搜索了Pubmed中富集功能与精神分裂症和抑郁症相关文献，结果证实有一部分富集的功能与精神分裂症或者抑郁症有密切的关系，如表8-22所示。
表8-22 文本挖掘搜索Pubm ed中与精神分裂症和抑郁症相关文献结果
注：Count（schizophrenia）代表该功能与精神分裂症相关的文献数目；Count（Depressive Disorder）代表该功能与抑郁症相关的文献数。