本文使用PCR-DGGE技术和Illumina Miseq第二代高通量测序技术相结合的手段对恩施地区腐乳中的微生物群落组成及多样性进行解析,同时利用传统纯培养的方法对其乳酸菌资源进行发掘。结果表明:隶属于变形菌门的绿脓杆菌属、不动杆菌属、鞘氨醇杆菌属、布丘氏菌属和草螺菌属为腐乳样品中的优势细菌属,同时PCR-DGGE技术与传统微生物培养方法显示腐乳中的微生物资源较为丰富且具有多样性。通过本研究的开展,可为传统大豆发酵食品提供优秀的菌种资源,同时更好地促进其产业化生产。