功能状况的自然分类研究——消化系统还是摄入系统
还原并揭示生命活动系统的功能发展规律和客观现实，以使其能够正确反映功能的全貌，从而建构更为科学合理的生理学，这是对生命科学的发展。按照生物分类和系统发展的进化论基本原理，结合科学实践的探索研究，消化系统反映了生命系统在摄入能量和物质时的核心功能——消化功能，虽然也能继续延伸到消化中的转运和消化后的吸收和排泄功能，但这个系统的整体功能还是未能被完整描述，加工和处理食物残渣的微生态缓冲功能、肠道内的卫生环境功能、消化道海关——屏障防御功能等，这些客观存在被描述在以消化为核心词的系统概念里，显然失去了生命活动摄入系统功能的原貌。
人和大多数动物都是开放式生命活动系统，系统与外界的能量和物质交换有赖于系统的交换功能，呼吸系统负责交换氧气和二氧化碳，摄入系统负责交换能量和营养素，从功能概念分类的角度看，摄入系统的功能概念分类，势必有食物经口摄入、在上消化道内的消化、在小肠的吸收、在大肠的排泄的主要功能，还有辅助这些主要功能的黏膜屏障和免疫、肠道内微生态和卫生环境、与进食和排泄管控有关的神经系统和激素内分泌系统等的功能。
在摄入系统功能自然分类思想的引导下，应用系统理论而进行的结构和功能细分，能够构建起功能健康状况更为有序的结构分类，以下以摄入系统的健康状况分类情况进行说明。
摄入系统功能（系统级分类），即对机体与外界进行能量和营养素交换的功能进行系统性概念下的分类——经口进食的自理能力，非摄入系统功能，但是本系统功能的衔接性功能。
1.口腔内摄入功能（摄入系统的一级分类）
（摄入系统的二级分类）包括：①咀嚼功能（牙、舌、口腔周围组织，三级分类）；②吞咽功能（会厌软骨、喉、咽呃腔组织，三级分类）；③唾液消化功能（唾液腺体、唾液分泌、唾液淀粉酶，三级分类）；④口腔内黏膜吸收功能（黏膜通透性、黏膜细菌和免疫屏障、黏膜吸收后转运，三级分类）。
2.消化道摄入功能（摄入系统的一级分类）
（摄入系统的二级分类）包括：①食道转运功能；②胃内消化吸收转运功能；③十二指肠—空肠—回肠消化吸收转运功能；④结肠和直肠内细菌再消化、吸收和转运、排便功能；⑤参与肠道摄入功能的“肝脏、胆囊、胰腺”消化功能。(https://www.daowen.com)
3.输入系统稳态维持功能（摄入系统的一级分类）
（摄入系统的二级分类）包括：①肠道黏膜屏障功能（细胞组织的结构屏障、免疫屏障、黏液及微生态屏障等，三级分类）；②肠道微生态功能（菌群结构、原籍菌的优势菌群地位、菌群所处的肠道卫生环境等，三级分类）；③肠道内免疫功能（炎症功能、免疫反应功能、炎症免疫平衡功能，三级分类）。
4.摄入系统组织结构状况（摄入系统的一级分类）
（摄入系统的二级分类）包括：①所有上述器官的解剖结构状况；②所有上述器官的组织学形态状况。
5.参与摄入系统功能的其他功能（摄入系统的一级分类）
（摄入系统的二级分类）包括：①参与摄入系统功能的神经体液调节功能；②与本系统功能密切相关的血液循环、淋巴循环、组织细胞物质交换功能。
