病因和发病机制
尚未完全明确，可能与下列因素有关。
（一）胃肠道动力异常
IBS患者存在多种胃肠运动功能紊乱。部分腹泻型IBS表现为胃肠通过时间缩短、结肠收缩增强等肠道动力亢进，而部分便秘型IBS则存在动力不足。如正常人结肠的基础电节律以6/min的慢波频率为主，而便秘或腹痛型IBS患者3/min的慢波频率显著增加，致使肠内容物推进减慢，水分吸引过多；腹泻型高波幅明显增加。
（二）内脏敏感性增高
直肠或结肠气囊充气试验表明，IBS患者痛阈下降，对直肠扩张等机械性刺激敏感性增高。这是引起IBS患者腹痛和腹部不适的主要原因。
（三）中枢神经系统感知和脑-肠轴调节异常
中枢神经系统（CNS）和肠神经系统（ENS）在本病中起重要作用。功能性磁共振成像研究发现，IBS患者与正常人之间存在大脑感知差异，IBS患者对直肠气囊扩张刺激所引起大脑反应区与正常人有所不同，且腹泻型IBS与便秘型IBS之间的大脑反应区也有不同。(https://www.daowen.com)
肠神经系统（ENS）含有许多神经递质，对肠功能起着调控作用，如5-HT信号系统是脑-肠轴中重要的信号分子和神经递质，有资料显示5-HT异常参与IBS肠道动力、脑-肠轴异常及内脏高敏感的发生。
（四）肠道感染
流行病学显示，部分IBS患者发病前曾有肠道感染史，急性感染期间焦虑和抑郁、经历更多的负性生活事件、合并神经过敏和疑病、腹泻持续时间越长的患者，发生IBS的危险就越大。肠道感染引起黏膜炎症反应、通透性增加及免疫功能激活与IBS发病有关。这种IBS也被称为感染后IBS（post-infection IBS）。
（五）精神心理异常
部分患者存在焦虑、抑郁、紧张、失眠等精神心理异常，心理应激也可诱发或加重IBS症状，说明精神心理因素与IBS密切有关。不良情绪通过脑-肠轴影响胃肠道的运动和敏感性，焦虑可增加前扣带回皮质活动而影响直肠痛觉。IBS患者人格和情绪状态是决定其是否就诊的重要因素并影响疗效。
（六）其他
其他如遗传因素、小肠菌群失调及食物耐受不良和食物过敏等也与IBS的发病有一定内在联系。