五、明清时期
明清时期涌现出大量本草学著作，其中个人编撰的著述占大多数，这一时期的本草学著作内容丰富，不仅药物数量多，对药物效能与治疗经验的阐述也比此前的著述更为翔实，编写的角度多样，具有综合与专题的不同特色。
1.《本草纲目》与李时珍
《本草纲目》是中国古代药物学发展的巅峰之作。作者李时珍（1518—1593年），字东璧，晚年自号濒湖山人，蕲州（现湖北蕲春）人。其祖父为铃医，父亲李言闻（号月池）为当地名医。李时珍自幼习儒，14岁曾中秀才，后3次乡试不第，于是弃举子业而跟随父亲行医，深得其父之传。他有感于本草书中错讹颇多，误人太深，于是发奋立志，决心修纂一部新的本草学著作。35岁时，他开始着手本草书的编撰。他参阅800余种文献，“渔猎群书，搜罗百氏。凡子史经传，声韵农圃，医卜星象，乐府诸家，稍有得处，辄著有数言”（王世贞《本草纲目》序）。他认真总结前人的经验，同时十分注重实地观察研究。他跋山涉水，亲历湖北、湖南、广东、河南、河北、安徽、江苏、江西等地走访考察验证，诚心诚意向药农、野老、樵夫、猎人、渔民等请教，从多方面获取知识。他历时近30年，三易其稿，终于在万历六年（1578年）编撰成《本草纲目》初稿。
《本草纲目》共有52卷，载有药物1892种，其中载有新药374种，收集医方11096首（其中8000余首是李时珍自己收集和拟定的），书中还绘制了1100余幅精美的插图，全书约190万字。《本草纲目》版本众多，历来除公认的祖本金陵本外，其余分为3个版本系统，分别是江西本、杭州本及合肥本，最早的版本是由南京胡承龙约在1593年刊刻的金陵本。1885年合肥本问世后，各家翻刻多以合肥本为底本。
李时珍另有《濒湖脉学》（1564年）、《奇经八脉考》（1572年）等流传于世。
《本草纲目》的主要成就如下。
（1）集明以前本草学之大成
该书以《证类本草》为蓝本，搜罗药物“不厌详细”，参考“八百余家”文献，亲自实地考察，精心编纂。全书记载了1892种药物，收纳诸家本草所收药物1518种，在前人基础上增收药物374种，纠正了以往本草学中的许多错误。书中以药类方，载方达万余首，另附药图1100余幅。《本草纲目》结构宏大、内容丰富，是对16世纪以前我国本草学全面系统的总结，其伟大成就对后来的本草学影响极为深远。
（2）创立了先进的药物分类方法
李时珍以“物以类聚，目随纲举”为宗旨，创立了“从微至巨”“从贱至贵”的分类方法，将药物按照自然属性分为水、火、土、金石、草、谷、菜、果、木、服器、虫、鳞、介、禽、兽、人16部，以此为纲，下属60类目，纲举目张，非常清晰，这是当时世界上最先进的药物分类方法。《本草纲目》改进了中国传统的分类方法，格式统一，叙述也更为科学和精密，例如：把广义的“虫”药扩充到106种，其中昆虫药为73种，分为“卵生”“化生”和“湿生”三类，这对动物和植物分类学的发展具有重要意义。《本草纲目》中的分类方法，已经过渡到按自然演化的系统，从无机到有机，从简单到复杂，从低级到高级，这种分类方法明显含有生物进化的思想，受到达尔文的高度重视。达尔文在《动物和植物在家养下的变异》一书中，引用了《本草纲目》中关于鸡的七个品种和金鱼家化的资料。《本草纲目》对植物的科学分类，要比瑞典分类学家林奈的分类早二百年。
（3）科学论述药物知识
李时珍在论述药物时，采用校正、释名、集解、正误、修治、气味、主治、发明、附录、附方等体例，对每味药物进行了详细的考证和阐述，书中引经据典，对药物的历史、形态、效能、方剂，叙述甚详。“发明”项尤为可贵，集中了李时珍的临证经验和实地考察结果，其中多有新发现、新经验、新见解。
（4）丰富了世界科学知识宝库
《本草纲目》不仅是一部药物学书籍，它还是一部中国古代自然科学知识的百科全书。书中第一次提出“脑为元神之府”的著名观点，从而认识到大脑在人的精神思维及中枢神经等方面的重要作用。《本草纲目》的医药学知识自不待言，还包含了植物学、动物学、矿物学、物理学、天文学、气象学、农艺学等领域的极为丰富的知识，后世许多科学家都到《本草纲目》中寻金探宝。
（5）保存了大量古代医药文献
《本草纲目》辑录了大量16世纪以前的医药文献，为后世保留了许多难得的古代文献资料，有些书籍现在已经无法看到，幸有李时珍在《本草纲目》中予以收载，使我们得以窥见佚书资料。
《本草纲目》涉及医学、药物学、生物学、矿物学、化学、环境与生物、遗传与变异等诸多科学领域。在化学史上，它较早地记载了纯金属、金属、金属氯化物、硫化物等一系列化学反应，同时记载了蒸馏、结晶、升华、沉淀、干燥等现代化学中应用的一些操作方法。李时珍还指出，月球和地球一样，都是具有山河的天体，“窃谓月乃阴魂，其中婆娑者，山河之影尔”。《本草纲目》不仅是我国的一部药物学巨著，也是我国古代的百科全书。正如李建元在《进〈本草纲目〉疏》中指出：“上自坟典，下至传奇，凡有相关，靡不收采，虽命医书，实该物理。”《本草纲目》自万历二十一年（1593年）刊刻行世后，屡经再版，世代相传，对祖国医学产生了深远的影响。由于该书卷帙浩繁，其后不少本草学著作以该书为蓝本，进行补遗、节要、改编，使之方便实用。《本草纲目》很早流传到朝鲜、日本、越南等国，先后被全译或节译成日、朝鲜、拉丁、英、法、德等多种文字，在亚洲、欧洲、美洲的许多国家和地区产生了巨大影响，李时珍也成为国际上公认的杰出科学家。英国著名科学史专家李约瑟在《中国科学技术史》中评价说：“毫无疑问，明代最伟大的科学成就，就是李时珍那部登峰造极的著作《本草纲目》。”1953年出版的《中华人民共和国药典》，共收载531种现代药物和制剂，其中采自《本草纲目》中的药物和制剂就有100种以上。英国生物学家达尔文称《本草纲目》为“1596年的百科全书”。2011年5月，金陵版《本草纲目》入选《世界记忆名录》。(https://www.daowen.com)
《本草纲目》乃是一部集16世纪以前中国本草学大成的著作，书中所收集的资料广博，不免有些内容与现代的认识不符，甚至有些可能带有迷信的色彩，例如，铅粉“辛寒，无毒”，现代则认为其有剧毒；又如人部收录的孝子衣帽、寡妇床头灰、人魄（人吊死后的魂魄，镇惊吓）、人肉（疗羸瘵，割股疗亲）、人中黄（人粪，治呕血）、梁上尘（治昏厥）等皆可入药。这部分李时珍大多引用《辍耕录》《本草拾遗》的说法，采以姑妄信之“凡经人用者，皆不可遗”的态度。另外，李时珍同时驳斥陈藏器的《本草拾遗》，认为“人肉疗羸瘵”是错误的。不过也正由于巨细靡遗的收录，一些已散佚的古代医书及本草借由《本草纲目》而保存下来。
《本草纲目》自出版至今历经400多年。据统计，有150余版《本草纲目》图书出版问世，平均每3年就有一种新的版本问世。历代出版的《本草纲目》多是根据金陵本《本草纲目》刊行的，所以后世学者所编、所著的《本草纲目》多在原著的范围内“打转转”，更不敢越“原著”雷池半步。如今，虽然时移势迁，沧桑巨变，但李时珍精神仍有超越时空的力量，《本草纲目》亦待更深入的研究和利用。当前，中医药发展站在更高的历史起点上，迎来了天时、地利、人和的大好时机，我们有必要充分继承《本草纲目》中医药并重、药食同源的思想，做到医必知药、药为医用，让其为中医药现代化发展和人类健康事业贡献更大、更多的能量。
《本草纲目新编》的编写基于李时珍《本草纲目》的编写体例，充分体现了李时珍当时的编撰思想，即“剪繁去复、绳缪补遗、析族区类、振纲分目”，又吸纳了1596年之后400多年来中医药学和现代科学技术的研究成果和临床应用经验，以继承、丰富、充实、提高和发展《本草纲目》的学术思想成就，为现代和将来的中医药科技工作者在临床、教学、科研等方面提供更翔实、更方便、更系统、更全面、更科学的大型专著，为实现中医药现代化、标准化、科学化、国际化提供参考。以湖北中医药大学副校长王平和著名中药学专家詹亚华为主编的编写团队就版本选择、校对考证、编排体例、内容安排、插图照片等一系列问题进行了反复讨论与论证，力求将原著编撰体例与现代中医药学著作的编写体例紧密结合，将现代中医药学有关研究成果贯穿其中，从而适应新时期中医药事业发展的需要，彰显新时期的中医药发展面貌，做到在继承中创新、在创新中发展、在发展中提高。
2.《本草述》与刘若金
《本草述》共32卷，刘若金撰。刘若金（1585—1665年），字用汝，号云密，潜江（现属湖北省）人。天启五年（1625年）刘若金中进士，以后由县令官至监司，忤时罢官归里，以“正气闻天下”。崇祯末年，膺荐复起，官至大司寇（刑部尚书），因此被称为刘尚书。随南明至闽海，后“见政柄下移，知事不可为”，坚乞骸骨，束身引退，隐居著述三十年，完成《本草述》一书。刘若金潜心辨析历代中医药文献370余种，十易其稿，于1664年撰著成《本草述》。该书共32卷，约80万字，对明代及以前的药学成就进行了综合整理，由博返约，使义明理博，对后世学者影响深远。该书论药宗经典而旁及各家，以《神农本草经》《黄帝内经》为析药之本，兼涉《丹溪本草》《珍珠囊药性赋》《汤液本草》《本草纲目》《神农本草经疏》《雷公炮炙论》《本草衍义》《用药法象》《用药心法》等著作中的药论及陈嘉谟、刘河间、陈藏器、卢复、卢之颐、王绍隆、李中梓、罗周彦、陆养愚等数十位先哲的用药心得，择其精辟者，“一一参契于《灵》《素》而详说焉”。全书载药480余种，分为水部、火部、土部、五金部、石部、卤石部、山草部、芳草部、隰草部、毒草部、蔓草部、水草部、谷部、菜部、五果部、山果部、夷果部、果之味部、果之蓏部、水果部、香木部、乔木部、灌木部、寓木部、苞木部、虫部、鳞部、介部、禽部、兽部、人部等。每药以正名为标目，正名之下或附以习见的异名；其下次列气味、主治、附方、修治等项，内容多采自诸家本草及方书；再下为刘若金个人所撰的按语，皆以“愚按”为题，系对药学理论尤其是药物效用机理的阐发。现存多种清刻本和石印本。该书对药物药性的讨论较《本草纲目》详细。1842年，清朝杨时泰重辑，名《本草述钩元》，共32卷。该书系《本草述》一书的摘要改编本。作者在不变更其药数、次序、分类的基础上，删去约百分之四十的次要内容，提要钩玄而成此书。现存几种清刻本。1949年后有排印本。
《本草述》的成就体现在以下几个方面。
（1）精选药物，由博返约
《本草述》载药480余种，较《本草纲目》而言，则为简约型本草，刘若金能删繁趋简而择其精要，调整分类而定其次序，广征诸家而重于临证，破疑察伪而辨其名实，引经据典而详析药理，是一部独具特色的本草学专著。但其关于药性药理的论述又占去了大部分篇幅，因而又是探究药学理论的专著。
（2）药物编排较《本草纲目》有改进
在《本草述》中，刘若金对李时珍及前人明显的疏漏误排之处，在一定程度上做出了调整。比如果之味部，《本草纲目》列胡椒于吴茱萸、食茱萸之前，刘若金考虑吴茱萸、食茱萸皆属椒类而产于中土，胡椒则来自舶上，遂将果之味部的顺序变更为蜀椒—吴茱萸—胡椒。同时将食茱萸附于吴茱萸之后，秦椒（花椒）附于蜀椒之后。经此变更后，同一部类药品的主从关系、等次关系、土产与舶产关系均有章法可循，检索功能与实用价值也能在不增加篇幅的情况下得以增强。
（3）方药结合，以临床为指导
《本草述》在论述药物时，“经之以药，纬之以方”，既按部类纵向阐明药物单用时的个性专长，又按配伍关系横向论述药物合用后药性的差异。
此外，《本草述》既注重以药理指导用药，也注重用临床疗效验证和充实药理。这一特点在论及“从昔本草皆不载”的药物时尤为突出。
（4）改正前人本草学错误
刘若金学博识精，善于折中古今异同。例如在论述茺蔚子的功效时，本书先引证《神农本草经》之说，称本品“主明目”，并籍录后世方书的意见，证实本品之治以目疾为多。本书难能可贵之处在于其通权达变，明确指出茺蔚子行血甚捷，血滞目疾者本品宜之，但瞳子散大者，属血之不足，理当禁用本品。另外，本书对李东垣所言茺蔚子助火之说，也给予了反驳。
在本草学专著中，《本草述》起到了承前启后的作用。刘若金以“由博返约”的方式研究本草的经验，对后世有较大的影响。例如道光六年（1826年）杨时泰偶获此书，“翻阅数过，爱不能释”，花了五年时间，又“就其中论义删而约之”撰辑成《本草述钩元》，经门人伍恂刊行于世。
由于时代及个人的局限，《本草述》对某些药物的解说有“文辞蔓衍”的缺点，但总体来说，《本草述》仍属本草学专著中的上乘之作。刘若金对医药事业发展所做的贡献，将永远为世人所景仰。