SSR数据中，遗传距离和地理距离的相关性表示地理距离是大王杜鹃导致遗传变异的主要因素。从cpDNA序列分析中的单倍型分布情况来看，不同地区的单倍型分布存在差异，同时，大王杜鹃生境呈相互隔离的片段化的地理分布格局，因此推测认为大王杜鹃可能存在多个孤立的避难所。
图6 大王杜鹃11个居群的遗传距离与地理距离的相关性分析示意图
