14.3.3 肿瘤类器官的筛选

14.3.3 肿瘤类器官的筛选

在鉴定时,类器官与其来源的肿瘤组织在特征基因上的重叠率可作为肿瘤类器官纯度的衡量指标。在利用原发肿瘤组织构建患者来源的类器官时,存在正常细胞来源的类器官潜在污染问题,往往需要采取策略以提高肿瘤类器官的纯度。由于肿瘤类器官和非肿瘤类器官形态不同,可根据镜下初步鉴定的结果手动移除非肿瘤类器官,也可以根据其密度或大小进行分离。此外,还可利用鉴定时检测到的突变对肿瘤类器官进行富集。例如,MDM2激动剂Nutlin-3可用于在混合的类器官中筛选TP53突变的肿瘤类器官[13],培养基中去除EGF可用于筛选RAS突变的肿瘤类器官[6,39,40]。但针对某种突变对类器官进行选择可能会导致类器官失去异质性,故应谨慎使用该类富集方法。由于从同一肿瘤的不同克隆建立的类器官对药物敏感性可能不同[41],还需要通过WES、WGS或Target-seq对筛选后的类器官系和原始组织进行对比,以确认筛选后的类器官仍然具有代表性。(https://www.daowen.com)