在母体内,胎儿肠道是无菌的,出生后数小时细菌即经口、鼻、肛门等侵入肠道。肠道菌群的细菌种类与摄入的食物有关,单纯母乳喂养儿以双歧杆菌占绝对优势,人工喂养和混合喂养儿肠道内的大肠埃希菌、嗜酸杆菌、双歧杆菌及肠球菌所占比例几乎相等。婴幼儿肠道正常菌群脆弱,易受多种因素的影响而致菌群失调,引起消化功能紊乱。