在得到了50个初始指标后，为了确认指标的有效性，又将9名不同领域的专家随机分为3个小组，就已得到的初始指标的重要度进行焦点团体访谈，旨在对从深度访谈中提取出的指标进行进一步的验证。通过此次焦点团体访谈，进一步挖掘了初始指标（二级指标）及其之间的关系，并对部分因素的范畴进行了删减。其中，删除了以下条目：

①11.项目时间分配的合理性——与时间投入具有一定的重复性。

②16.项目中整合自然资源的能力——对于生物领域有一定的意义，但不普遍应用于农业。

③17.项目相关主体的参与——产学研有一致性。

④21.项目申请书的质量——太过笼统，属于诸多指标因素的综合体现。

⑤29.项目技术转化前景——与创新需求、技术产出等因素重复。(www.daowen.com)

⑥33.项目对行业发展的促进作用——与示范作用、社会效益、经济效益等重复。

⑦37.项目的环境效益——与社会效益等有一定的重复，将环境效益条目并入社会效益。

⑧43.申请人组织能力——在立项申请书中不能得到有力的判断。

⑨46.申请人所在机构的科研实力——通过机构的创新资源、设备投入等可以进行判断。

最后进行理论饱和度（决定何时停止采样的鉴定标准）检验，它是指分析者已经到了不能通过继续获取数据以使分析者进一步发展某一结论的时刻。本研究将受访者进行随机抽取，发现从他们的谈话中确实已经不能再提取出新的理论。因此，通过案例研究中的理论饱和度检验，可以认为该指标已具有全面性。