医学类书、丛书和入门书
清代中医全书、类书、丛书与入门书主要有陈梦雷《古今图书集成·医部全录》、吴谦《医宗金鉴》、纪昀《四库全书·子部·医家类》、陈修园《南雅堂医书全集》、唐宗海《中西汇通医书五种》、周学海《周氏医学丛书》和程国彭《医学心悟》等。
（一）《古今图书集成·医部全录》
《古今图书集成》原由陈梦雷（1650—1740年）编纂，后经蒋廷锡（1669—1732年）重编。该书分为历象、方舆、明伦、博物、理学、经济六编，每编32典，每典分6117部；每部先汇考，次总论，有图表、列传、艺文、纪事、杂录、外编等。共计10000卷，目录40卷。包括天文地理、人伦规范、文史哲学、自然艺术、经济政治、教育科举、农桑渔牧、医药良方、百家考工等，与《永乐大典》《四库全书》齐名。
《博物编·艺术典》列医部，收录自《内经》至清初120余种中医文献，分类编纂为520卷。以《医部全录》为名，另印成帙。内容包括古典医籍注释、临证各科证治、医家传略、医学艺文与记事等，记述系统，分门别类明确，各科证治有论有方，引证材科均详注出处，标明书名、篇目和作者，便于查对原书。《医部全录》为中医类书之冠，至今仍不失为研究中医学术渊源的重要参考。
（二）《医宗金鉴》
主编吴谦（1689—1748年），字六吉，歙县（今属安徽黄山市）人，太医院院判。吴氏于乾隆四年（1739年）奉旨，广泛采辑《内经》至清初医书，“分门别类，删其驳杂，采其精粹，发其余蕴，补其未备”，于乾隆七年（1742年）撰成《医宗金鉴》90卷，丛书包括《订正仲景全书伤寒论注》《订正仲景全书金匮要略注》《删补名医方论》《四诊心法要诀》《运气要诀》《杂病心法要诀》《妇科心法要诀》等15种，内容涉及伤寒、金匮、方论、诊法、运气、杂病、妇科、幼科、痘疹、外科、眼科、针灸、正骨等，配以歌诀，附以插图，并收集历代名方200首。乾隆十四年（1749年），太医院将其作为教材应用，对后世产生重大影响。
（三）《南雅堂医书全集》
编撰者陈修园（1753—1823年），字念祖，又字良有，号慎修，撰《南雅堂医书全集》，又名《公余十六种》，于同治四年（1865年）刊行。该书包括陈氏所撰医籍16种，即《灵素节要浅注》《金匮要略浅注》《金匮方歌括》《伤寒论浅注》《长沙方歌括》《医学实在易》《医学从众录》《女科要旨》《神农本草经读》《医学三字经》《时方妙用》《时方歌括》《景岳新方砭》《伤寒真方歌括》《伤寒医诀串解》《十药神书注解》。内容涉及基础理论及临床各科，采用歌括阐注形式，解释深奥医理，浅近易懂，切于实用，流传甚广，对普及中医作出重要贡献。
（四）《医学心悟》
撰者程国彭（约1662—1735年），字钟龄，号恒阳子、普明子，歙县（今属安徽黄山市）人。曾攻举子业，后因病潜心医学，撰成《医学心悟》6卷，初刊于雍正十年（1732年）。该书对基础理论和临证辨治都作详述，论证皆列病源、症状、诊断、治疗各项，并载自拟经验效方，注重病因和辨证的研究，以寒热、虚实、表里、阴阳八纲总统辨证纲要，强调治法以汗、吐、下、和、温、清、补、消八法尽之，所述医门八法颇具特色。所创止嗽散、启膈散、消瘰丸等方剂为近代医家所习用。该书门类齐全，通俗易懂，是中医入门必读之书。