迷迭香抗病虫害能力强，偶发病害主要有灰霉病、白粉病和茎腐病。灰霉病可用5%多菌灵烟熏剂或50%速克灵1500倍液防治；白粉病选用20%三唑酮乳油2000倍液防治；茎腐病可用50%多菌灵或甲基托布津2.00～1.25 毫克/升药液进行喷洒。虫害主要有蚜虫和白粉虱，可采用5%扑虱蚜2500倍液和1.5%阿维菌素3000倍液喷施防治。
