管理市舶司的机关
元朝延续大蒙古国时期形成的经商传统，并接受了宋朝的做法，建立起自上而下的赢利系统。市舶司属于元朝赢利系统的基层。
掌管市舶司的上级机关并不固定，有过几次变动，但基本上是在地方官府和泉府司系统之间转换，并以前者为主。
在至元二十一年（1284年）首次撤销市舶司以前和元朝中后期，是地方官府掌管市舶司的时期。
至元二十一年以前，市舶司管理基本循行从前的做法，由地方官兼领。至元十四年，泉州市舶司由“忙古䚟领之”，庆元、上海、澉浦市舶司，“安抚使杨发督之”。[5]约在至元十五（1278年）或十六年，百家奴升任镇国上将军、海外诸蕃宣慰使，兼福建道市舶提举。[6]宋朝重文抑武，不会让武将手握大权，以军官身份兼任市舶提举是元代不同于宋代之处，但这并未突破前代地方官兼任市舶司长官的框架，几年间市舶司的上司基本上是行省和宣慰司。行省的全称是行中书省，元朝地方最高行政机构，由朝廷直接管辖。宣慰司地位在行省之下、州郡之上，掌管军民之事。(https://www.daowen.com)
设置在广州的市舶司，曾由广东都转运盐使兼管。合剌普华卒于至元二十一年（1284年），曾以广东转运盐使的身份“兼领诸蕃市舶”。[7]泉州的市舶司，曾由福建市舶总管府管辖，在至元二十（1283年）年三月，福建市舶总管府被取消。[8]
延祐四年（1317年）五月撤罢泉府司。[9]市舶司及外贸回归元朝初年由宣慰司、行中书省等行政系统管辖的单纯状态，直至元朝末年。
在元代，地方官府管理市舶司历时长，作用较大，统治者主要通过这个系统获取外贸收益。
在至元二十一年（1284年）到延祐四年（1317年）的三十多年间，有些时候市舶司归泉府司系统管辖。
这是一段“禁商下海”频发时期。海禁时期，市舶司多被撤并；海禁过后市舶司恢复，有时处在泉府司系统的管辖之下。市舶司处于泉府司系统管辖之下，大致有以下几个时点：
第一，至元二十二年（1285年）八月，元朝取消首次海禁，“罢禁海商”。[10]次年八月，因海禁归并掉的市舶司被复置，归属于泉府司。[11]泉府司管辖市舶司的历史由此开始。
第二，至元二十五年（1288年）四月，市舶司因泉府司官员沙不丁、乌马儿的奏请而复置，[12]泉府司又成为市舶司的上司。
第三，至元二十六年（1289年）闰十月，江西行泉府司获得朝廷拨给的至元宝钞一千锭为本，每年向朝廷输送奇珍异宝。[13]江西行泉府司所以能每年向朝廷输送奇珍异宝，因为管辖着本行省广州港的市舶司。
第四，至元三十年（1293年），在元朝第二次海禁结束后制定的《至元法则》，将市舶司置于行泉府司的管辖之下。[14]
第五，至大元年（1308年），第四次海禁结束，当局恢复泉府院，“整治市舶司事”。[15]市舶司又在泉府司的系统之中。
但在泉府司管辖市舶司的时候，行省依然掌握外贸管理权。至元三十年（1293年）颁布的《至元法则》第四条规定：“如有进呈希罕贵细之物，亦仰经由市舶司见数，泉府司具呈行省，行省开坐移咨中书省闻奏”；[16]第二十条：“行省、行泉府司、市舶司官，每岁若至舶船回帆时月，预期前去抽解处所，以待舶船到来，依例封堵，检次先后，随时抽收”；[17]第二十二条：“抽分市舶关防节目，若有该载不尽，合行事理，行省、行泉府司、各处市舶司所在官员奉行谨守，不得灭裂违犯。”[18]上面的三条规定显示，外贸管理架构包含行省。行省的地位高于行泉府司。延祐四年（1317年）五月，元朝废罢泉府司，[19]市舶司受泉府司领导的历史就此终结。