二、糖蛋白抗原
糖蛋白抗原是细胞膜成分异常糖基化而形成的抗原。这类物质又是单克隆抗体，故又称为糖类抗原（carbohydrate antigen，CA）。这类抗原标志物的命名是没有规律的，有些是肿瘤细胞株的编号，有些是抗体的物质编号，常用检测方法是单克隆抗体法，有的还同时用两种不同位点的单抗做成双位点固相酶免疫法，这些与一般化学法测定比较，特异性有很大提高。而对一些糖类抗原的异质体，则通常用不同的植物凝集素来进行分离检测。
（一）CA50
这是一种唾液酸酯和唾液酸糖蛋白，正常组织中一般不存在，当细胞恶变时，糖基化酶被激活，造成细胞表面糖基结构改变而成为CA50标志物。许多恶性肿瘤患者血中CA50皆可升高，如66.6%的肺癌、88.2%的肝癌、68.9%的胃癌、88.5%的卵巢或子宫颈癌、94.4%的胰腺或胆管癌，其他如直肠癌、膀胱癌等皆有70%以上是升高的。
（二）CA125
最初认为它是卵巢癌特异的，但深入研究，它也是一种广谱的标志物，如82.2%的卵巢癌、58%的胰腺癌、32%的肺癌及其他非妇科肿瘤皆有不同程度的升高。但作为卵巢癌的辅助诊断，CA125是一个重要的标志物，与病程有关。
（三）CA15-3
这是乳腺细胞上皮表面糖蛋白的变异体，近年推出作为乳腺癌标志物，正常小于40 U/m L。哺乳期妇女或良性乳腺肿瘤皆低于此值。乳腺癌晚期100%和其他期75%患者存在此值明显升高。50%的肝细胞癌患者、53%的肺癌患者、34%的卵巢癌患者均可见该标志物，因而该标志物是广谱的。由于CEA在乳腺癌中也有诊断价值，如两者联合可将阳性率提高10%。
（四）CA19-9
CA19-9为唾液酸化的乳-N-岩藻戊糖Ⅱ，是一种类黏蛋白的糖蛋白成分，与Lewis血型成分有关。异常升高也是在多种肿瘤出现，如79%胰腺癌、58%结肠癌、49%肝癌、67%胃癌，胆囊癌、肺癌、乳腺癌皆有10%左右升高。
（五）CA549(https://www.daowen.com)
CA549也是乳腺癌的标志物，它是一种酸性糖蛋白，大部分健康女性小于l U/m L，异常升高者比例并不高，可见于50%乳腺癌、40%前列腺癌、33%肺癌患者。由此，作为乳腺癌的早期诊断，CA则还较欠缺，应联合应用其他TM。
（六）CA72-4
CA72-4是一种高分子量糖蛋白，正常人血清中含量小于6 U/m L，异常升高在各种消化道肿瘤、卵巢癌均可产生。对于胃癌的检测特异性较高，以大于6 U/m L为临界值。良性胃病仅小于1%者升高，而胃癌升高者比例可达42.6%，如与CA9-9同时检测，阳性率可达56%。
（七）鳞状细胞相关抗原（SCC）
这是从宫颈癌细胞中提纯的，是宫颈癌特有的TM。SCC在正常鳞状上皮细胞内也存在，随着鳞状上皮细胞的增殖（恶性）而释放入血。异常升高可见于宫颈鳞癌，21%宫颈腺癌也有升高。肺鳞癌有较高的阳性率，各家报道从40%~100%不等，而小细胞肺癌阳性率则较低（3.7%）。食管鳞状上皮癌、口腔鳞状上皮癌皆有较高的阳性率，且随肿瘤的分期呈现不同变化（20%~80%）。可见SCC是鳞状上皮癌的重要标志物。
（八）CA242
这是一种黏蛋白型糖抗原，可作为胰腺癌和结肠癌特有的TM，其灵敏度与CA19-9相仿，但特异性、诊断效率则优于CA19-9。在肺癌等其他恶性肿瘤中也有较高的检出率。
（九）NMP22
系核基质蛋白（nuclear matrix protein，NMP）是膀胱癌的一种新的标志物，检测尿NMP22可鉴别良恶性膀胱疾病。